高昌馆来文，明代高昌馆汇编的汉文回鹘文对照的公文集。亦称《高昌馆课》。

高昌馆为明清边疆民族语文翻译机构，专司中央政权下达的敕谕、所辖各地方政权与中央政权往复奏折以及朝贡等翻译事务。明永乐五年(1407)设置，隶四夷馆。

此集约成于成化至嘉靖(1465—1566)年间。共收文书89件。

内容多为当时新疆各地，包括哈密、高昌、土鲁番、亦力把里等20余个地方政权向明廷进贡、求赏的奏文，反映了新疆诸族与明廷的政治臣属关系及经济、文化交流。其中以回鹘文书写的原文大部分都用汉文逐字直译，相互对照，便于查阅，但未能正确反映当时回鹘人的口语及回鹘文文法方面的特点。对研究民族关系史以及回鹘文有一定价值。有北京图书馆藏本，新疆人民出版社出版该公文集。