《魔法树屋》根据1992年美国同名人气儿童书改编，以两兄妹作为主角，哥哥杰克喜欢看书和学习但缺乏勇气，妹妹阿妮喜欢冒险并与动物相处愉快。有一天，两人在森林的树上发现一间不可思议的小屋。实际上这是能够穿越时空的魔法小屋，两兄妹在走入小屋后也穿越了时空，遇到了变成老鼠的摩根先生。为了拯救摩根，由此展开了跨越不同时代与场所的冒险。