在虹口区溧阳路1359号（原狄思威路766号）二楼，是一幢红瓦灰墙砖木结构的三层新式里弄房屋，坐北朝南，占地面积140平方米，建筑面积386平方米，建于民国9年（1920年）。鲁迅存书室是二楼东前间，面积20.5平方米，存书时间从民国22年3月27日至民国25年10月。鲁迅逝世后夫人许广平将藏书迁往淮海中路淮海坊时止。

民国22年期间，溧阳路1359号的房东姓阪本，是内山完造的朋友，其他住户也都是日本侨民。淞沪战争期间鲁迅因日军曾借故搜查寓所，在决定迁居大陆新村9号时，将寓所与大量藏书分开，通过内山完造以内山书店职员镰田诚一的名义租了这间存书室。

存书室有两扇门，朝北的门通向楼梯间，平时由此门进出，另一扇门通向二楼中间阳台，此门常年关着。存书室东、南两面有窗，窗下有书桌和椅子，中间一张方桌，靠墙是用本色无漆的木板制成的书箱叠成书架，由上而下几乎到顶，存放着鲁迅从寓所移来的马克思、恩格斯、列宁、斯大林著作及其他社会科学、文学、美术等方面的书籍约6000册，并珍藏着瞿秋白、柔石等人的手稿和纪念物。存书室平时门窗紧闭，并得到内山完造和同宅日本友人掩护，在鲁迅存书期间未受租界当局和国民党特务的干扰。

抗日战争胜利后，日侨回国，溧阳路1359号由中国居民迁入。

因鲁迅在上海的藏书绝大部分于1950年由许广平送交北京鲁迅故居保存，鲁迅存书室未按原状恢复，房屋基本上保持了历史原貌。

1977年公布为上海市文物保护单位。