鳄龙外表类似恒河鳄或马来长吻鳄。这动物的头骨有长而细的口鼻部，布满小而锐利的圆锥状牙齿。这导因于鳄龙与恒河鳄拥有相似的生态位：在河流与沼泽中猎食小型水生猎物。这是个Evolutionary relay的典型例子。更原始的离龙类有更短、更宽广的口鼻部。
它们跟恒河鳄与其他鳄鱼的主要差别在于头颅。眼眶在头颅的前方，头颅后部则是球根状膨胀且内部空间有许多复杂的骨弓。这些空间可能容纳巨大的下颚肌肉。其他关于这些空间的假设，例如耳部感应器官所在，但已被推翻，因为证据很少。外部鼻孔在喙部尖端上发现。这显示当鳄龙浸泡在水里，在河床或湖床上休息时，将它们的喙部上的鼻孔伸出水面来呼吸。鳄鱼与植龙目的
鼻孔分别是位在它们的喙部背部以及头颅。这些位置让它们在水面下休息。
鳄龙的头骨非常类似
蜥蜴的头骨，但较沉重。这让某些研究人员认为鳄龙科属于有鳞下纲。但是，鳄龙缺乏有鳞下纲的复杂方骨。因为同时拥有双弓动物两个生物群的特征，离龙目在种系上的位置非常地不明确。
离龙目的其他特征，包括沉重且骨化的腹膜肋，以及改造过的四肢末端，前肢被当作桨来使用。此外，鳄龙的肋骨是短而巨大的，如同其他水生爬行动物。胸部呈背腹平坦状，尾巴的侧向呈扁状，有助于游泳。在鳄龙化石上发现的皮肤压痕，显示鳞片非常小且不互相重叠，皮肤没有
鳞甲，而鳄鱼身上有鳞甲。