黄山学院徽州文化研究所成立于1994年6月，2006年正式定编定岗，是学院专门研究徽州文化的科研机构。其主要任务是弘扬中华优秀传统文化，开展徽州文化研究，组织学院徽文化特色课程教学，促进国内外学术交流，服务于现代化建设。

多年来，在上级领导和学校的关心支持下，经过全体研究人员的努力，研究所组织和参与了各类徽州文化学术研究活动，承担了国家、省、校各项徽州文化科研项目，开展国内外学术交流，出版、发表学术论著，培养徽州学人才，收集徽州文献资料，为推动徽州学成为和藏学、敦煌学齐名的显学作出了贡献。