1948年9月15日夜，上海国民政府中央情报第八局情报处处长齐佩林抓获了中共江苏省委交通员秦佑天。秦佑天随即叛变，并表示要亲自向局长潭忠恕指认一名隐藏在第八局多年的中共卧底。当潭忠恕赶到时，发现秦佑天被杀，口供已被销毁，一只留下部分残片，从残片中意外发现了一个熟悉代号——“水手”，他的夙敌。“水手”到底在哪里？局里是否存在卧底，如果存在的话——会是谁。
曾用名刘智友，到
黄埔军校上学后改名刘新杰，湖南新化人。国民党陆军上校情报官。黄埔军校毕业。
抗日战争中战功卓著。后因伤病离开前线，被调至第八局，可是由于脑部受到过震伤，刘新杰有耳聋和健忘的毛病，被情报局视为鸡肋。因为既是同乡又是黄埔同袍，刘新杰在战场上还曾经救过谭忠恕的命，谭力排众议留他在机关里，担任一个审批经费开支的闲职。他就是“水手”要唤醒的那个关系人。多年来他一直默默潜伏，并且经营出一个隐藏在国民党军事情报部门中的网络，他从来没与上海地下党发生过任何联系，因为他的任务是随着国民党残部撤退台湾，继续敌后工作。
国民党陆军少将情报官。黄埔军校毕业。谭忠恕酷爱数学，是个精通各种解谜游戏的高手，也是无师自通的心理学家。他从抗日战争后期开始进入国民党陆军情报第八局，在情报工作中表现出非凡的才干，得到迅速擢升，抗战胜利后，他成为该局历史上最年轻的局长。1948年9月的一天，谭忠恕突然得到一份名单，是共产党上海的特工网络，网络的顶端，是一个代号“水手”的神秘人物。这个“水手”，是谭忠恕多年来的夙敌，是他的一块心病。
该剧主要讲述1948年秋的上海，“水手“段海平领导的中共地下党组织为了获取国民党的潜伏计划，在卧底多年的中共党员刘新杰的暗中帮助下，与谭忠恕为首的国民党第八情报局特务，围绕“追查水手”和“木马计划”展开生死较量的故事。