黑衣组织，日本漫画《名侦探柯南》及其衍生作品中的组织，组织正式名称不详，是一个笼罩在神秘色彩中的跨国犯罪组织，被江户川柯南称为“乌鸦军团”。主人公工藤新一正是被组织成员琴酒灌下APTX4869，才在药物偶发作用下身体缩小成小学生模样，从而开始了整个故事。

该组织的真实名称不详，一般以“黑衣组织”、“组织”代称，组织势力遍布全球、资产雄厚，在日本乃至全世界的政界、经济界和科学界中暗中操控着众多的线索和人物。这个组织行事极为隐秘，成员们都穿着如乌鸦般漆黑的衣服。

黑衣组织擅长在世界各地的医学、财经和科学界吸收有前途的人才，并通过金钱手段进行收买和控制，将他们纳入自己的势力范围。同时，组织还聚集了大量资金用于开发神秘的药物和具有全球影响力的程序，这些项目的具体目的和用途都不为人知。

黑衣组织还和世界各地的地下【军火商】成为合作伙伴，并跟对方秘密交易了各种各样的大规模武器装备。

这个组织的成立时间至少已经有半个世纪之久，他们一直在实施着一系列秘密计划，这些计划涉及广泛且深远。尽管FBI和CIA等情报机构已经对黑衣组织展开了长期调查，但至今仍未能完全揭露其真实面貌和完整结构。

由于组织的极端隐秘性和复杂性，黑衣组织的目的目前仍笼罩在迷雾之中，尚未被完全揭示。

从已知的信息和线索来看，组织可能致力于开发某种极为神秘且影响力巨大的药物，这种药物有可能涉及到人类生命的本质，如永葆青春、时间倒流，甚至拥有使死人复生等超乎想象的效果。但关于“APTX4869”是否就是这种传说中的药物，目前还存在诸多疑问和争议。组织成员琴酒坚信“APTX4869”是一种杀人毒药，其开发者宫野志保却曾有过用它自尽的念头，这暗示了这种药物可能具有多重效果和极为复杂的性质。不过，作者青山刚昌在访谈中明确表示，“长生不老”并非组织的真正目的，这似乎又在为整个故事增添了更多的悬念和可能性。

此外，黑衣组织还委托过外部人士板仓卓，开发一款用途不明的系统软件。板仓卓在透露这款软件的信息时，曾表示自己是为了“全人类”而决定终止软件的开发。

40年前，乌丸莲耶因“黄昏公馆”暗号相关事件，残忍地杀害了多位学者。

20年前，贝尔摩得杀害茱蒂的探员父亲。19年前，宫野夫妇加入乌丸赞助的研究设施，并带着女儿明美进行了与组织相关的秘密活动。而后，发生了一系列事件，宫野夫妇在事故中丧生、羽田浩司被人杀害、浅香失踪、赤井务武死亡。

10年前的一个偶然，工藤新一在海边遇见了赤井一家。5年前，赤井以诸星大的身份成功潜入组织，并获得“黑麦”代号。与此同时，本堂瑛海也潜入组织，开始以水无怜奈的身份活动。在接下来的几年里，黑衣组织继续其血腥与阴谋，伊森·本堂为保护女儿伪装自杀，苏格兰因身份暴露而自尽。3年前，世良真纯和玛丽的离日赴英。

2年前，联邦调查局对琴酒的追捕行动失败，赤井在这次混乱中成功脱离组织。同时，龙舌兰接触软件工程师板仓卓，委托其开发软件。

1年前，在纽约，毛利兰与工藤新一认识了女演员莎朗·温亚德。在回家的路上，莎朗赠予的手帕不慎飞出了车外，两人决定下车寻找。在这时，遇到了正在追查组织成员贝尔摩得的联邦调查局搜查官赤井秀一。

而后，毛利兰偶然在楼梯里遭遇了贝尔摩得易容成的银发杀人魔，在银发杀人魔想杀害毛利兰的时候脚滑了一跤，毛利兰救下了他，因此贝尔摩得对兰心存感激，并称她为“Angel（天使）”。

高中生侦探工藤新一与青梅竹马毛利兰在游乐园游玩时，偶然目睹了黑暗组织的非法交易。专注于观察交易的新一未能察觉到背后悄然逼近的危险，琴酒突然出现，强行将毒药“APTX4869”灌入新一的喉咙，令他陷入昏迷。待新一醒来，发现身体竟然缩小了。

在阿笠博士的建议和帮助下，新一决定隐瞒身份。他改名江户川柯南，寄宿在父亲为著名侦探的毛利兰家中，开始调查黑衣组织。

毛利小五郎等人收到“贝尔摩得”发来的派对邀请，虽然灰原哀极力反对柯南参加活动，但最终还是被柯南用麻醉针麻倒。柯南假扮灰原哀接到“新出医生”的电话，不久后，茱蒂抢先在“新出医生”前来到博士家接“灰原”，后来发现“新出医生”就开车跟在茱蒂车后，茱蒂引着“新出”来到无人码头。

随后，两人正式开始对峙，揭晓“新出医生”是贝尔摩得假扮以及茱蒂老师FBI探员的身份，两人之间发生激烈的枪战，但贝尔摩得早就预料到茱蒂的行动，并在此设下狙击埋伏，子弹击中茱蒂，使她失去行动力。在危急时刻，柯南揭下伪装面具，用球击飞贝尔摩得手中的枪，他本想用麻醉枪逼迫贝尔摩德就范，但真的灰原哀突然出现，柯南一时分神，贝尔摩得抓住他的麻醉枪并将其麻醉，随后又掏出一把手枪准备解决灰原，但藏在茱蒂车里的毛利兰突然出现，用自己的身体掩护灰原。茱蒂爬到了卡瓦尔多斯狙击的死角，并捡起了枪对准贝尔摩得，赤井秀一突然出现，打伤卡瓦尔多斯的双腿，并缴下了他所有的武器。

看到赤井后，贝尔摩得乱了方寸，想开枪击杀赤井，但赤井抢先一步用霰弹枪击中贝尔摩得，受伤后的贝尔摩得抱起昏睡的柯南做人质逃跑到深山里，与BOSS发完邮件后，她发现柯南身上安装了心电监视器的电极、信号发信器和录音机，原来柯南早就醒了过来并录下了邮件地址的按键音及电话录音，并要求其带自己去见BOSS。贝尔摩得假意服输，突然放出催眠瓦斯，后来贝尔摩得开枪打伤自己保持清醒，破坏了设备，离开了现场。

江户川柯南调查发现水无怜奈竟是组织成员“基尔”。基尔在执行暗杀土门康辉的任务时遭遇车祸，身受重伤，昏迷许久。在这段时间里，她一直受到FBI的严密监控和保护。

后来，柯南发现基尔其实是CIA的卧底，为将其送回黑衣组织，并帮助其骗取琴酒的信任，秀一与柯南联手策划了一个大胆的“殉职”计划。在行动中，秀一巧妙地在手指上涂上了一层透明涂层，并利用柯南留有楠田陆道指纹的手机制造了假象。成功将水无送回组织后，琴酒开始怀疑她的忠诚，要求她引诱秀一独自驾车来到来叶山。

在出发前，秀一涂在手指上的涂层被詹姆斯发现，但他仍要求詹姆斯瞒过茱蒂等人。到达来叶山后，在琴酒的严密监视下，赤井被水无枪击头部，他的座驾雪佛兰车也被水无引爆焚毁。赤井秀一“假死”后，以冲矢昴的身份继续活动。

水无怜奈重新回到组织后，得知组织中出现了一个厉害的侦探角色——波本。波本以安室透的身份接近毛利小五郎，试图找到赤井秀一和雪莉的线索，还伪装成“伤疤赤井”进行活动，最终得出“赤井已死”的结论。

随后，在特快列车事件中，安室透揭示自己的真实身份是波本，并计划将雪莉带回组织，但最终未能成功，并误以为雪莉已死。此后，他重新开始调查赤井秀一。

通过一系列事件和线索，柯南猜测降谷零属于日本公安警察，后降谷零与赤井秀一在来叶山的电话联络中，赤井说出他已根据其透露的“零”调查出降谷零的本名，并揭晓其日本公安警察卧底的身份。

工藤新一在京都破案的事情被传到网上，引起了媒体的大量报道，虽然事后有希子和优作拜托发帖者“辟谣”，但还是引起了朗姆的注意。工藤优作和有希子回到日本，工藤优作通过与赤井秀一的交谈，推理出组织的首领是乌丸莲耶。

FBI的探员被连续杀害，柯南发现FBI的暗号被黑衣组织破解，于是与FBI合作设下圈套引黑衣组织上钩。然而，黑衣组织中的朗姆识破了计谋，导致FBI陷入险境。在逃亡和对抗过程中，卡迈尔被黑衣组织追杀，但最终在柯南和秀一的帮助下成功逃脱，为了掩盖卡迈尔的存活，秀一利用假象让黑衣组织误以为卡迈尔已死。最后，朗姆身份揭晓，朗姆戴上假发、假牙、胡须、眼罩，打开车门，以胁田兼则的身份下了车。

朗姆以胁田兼则身份送寿司到帝丹小学，并注意到若狭留美的目光。他询问柯南关于若狭留美的情况，但一无所获。后来，他通过毛利小五郎得知若狭留美的去处，并命令基安蒂和科恩狙杀她。但若狭留美察觉到朗姆的行动，利用小林澄子和少年侦探团成员暴露基安蒂和科恩的位置，并用猎枪击伤基安蒂。朗姆只好下令撤退，并改变对付若狭留美的策略。

参考资料：

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（注：该部分收录受组织利用、进行犯罪的人物，剧情中未告知这些人物为组织成员）

（注：本部分收录剧场版、漫画特别篇等非原作中出现的正式组织成员）

黑衣组织始终保持着高度的保密性和隐蔽性，即使是组织内部的成员之间也未必能够互相了解。该组织有着严格的纪律，任何不合格的成员、暴露组织身份的成员和背叛组织的成员都会被迅速铲除。

除了组织首领乌丸莲耶之外，组织内的核心成员都使用酒名作为代号，代号一般为组织首领所赋予，没有代号的基本都为组织的基层人员。据作者青山刚昌透露，使用代号的成员通常属于同一级别。

黑衣组织极其神秘，其成员均着如乌鸦般漆黑的衣服，令人难以捉摸。

注：带*表示虽然有黑衣组织的成员登场，但是与黑衣组织本身无太大关联。

带◆表示尚未改编成动画片。

注：带★表示动画特别篇；带*表示虽然有黑衣组织的成员登场，但是与黑衣组织本身无太大关联。括号内表示海外版集数。

包含衍生动画和漫画