人类CD44基因位于11号染色体短臂，全长约50kb，共由20个高度保守的外显子组成，每个外显子长度70-210bp不等，中间由长短不一的内含子分隔。CD44基因的20个外显子按照转录方式不同可分为组成型外显子（C）和变异型拼接外显子（V）两大类。组成型外显子共有10个，存在于所有转录产物之中。仅含有组成外显子的CD44转录子称为标准CD44（CD44S），其编码产物由361个氨基酸组成，该蛋白质有4个功能区。成熟CD44蛋白无信号肽区，预计分子量37.2KD，经过翻译后糖基化等加工，CD44S蛋白质分子量可达80-90KD，这种蛋白质可与组织间隙中微静脉末端的高柱状内皮细胞表面的透明质酸结合，在淋巴细胞回归到粘膜和引流淋巴结中具有重要作用。变异性拼接外显子也有10个，位于第5、6组成型外显子之间，总长1245bp，含有变异性拼接外显子的CD44转录子称为CD44V。CD44V转录方式十分复杂，可连续性转录，也可跳跃性转录，参加拼接的外显子可多可少，从而使转录片段长短不一。

对CD44的研究时间较长、较深入亦较广泛。已知其为分布极为广泛的细胞表面跨膜糖蛋白，主要参与异质性粘附，即肿瘤细胞与宿主细胞和宿主基质的粘附，异质性粘附在肿瘤细胞侵袭转移中起促进作用。

CD44蛋白的主要功能可归纳为：（1）介导淋巴细胞与毛细血管后小静脉中的高柱状内皮细胞结合，使淋巴细胞穿过血管壁回到淋巴组织；（2）参与淋巴细胞的激活过程；（3）与细胞外基质中的透明质酸、层粘连蛋白等基质分子结合；（4）能与细胞骨架蛋白结合，参与细胞伪足形成，并与细胞的迁移运动有关。

CD44与肿瘤浸润转移关系的研究已有大量报道。已在人类各种恶性肿瘤的研究中发现CD44S普遍存在，CD44V在恶性肿瘤组织中阳性表达率高低不一但阳性表达者较易发生脉管浸润和远处转移，阳性表达者无瘤生存期短，生存率低，预后差。

近年来有研究表明CD44v6可能是β-cat-TCF/LEF复合体的靶基因。对其与肿瘤转移关系的研究报道较多。广西医科大学韦敏怡、张增锋等用免疫组化SP法检测了81例鼻咽癌组织中CD44v6蛋白产物。结果CD44v6表达率为72.8%。51例颈淋巴结转移阳性组CD44c6蛋白表达率（82.4%）高于30例阴性组（56.7%）(P<0.05)。表明CD44v6基因在鼻咽癌淋巴结转移过程中起重要作用，CD44v6基因的表达可作为临床预测淋巴结转移和估计预后的重要指标。