PubMed 是一个提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要,并且免费搜寻的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。
简介
PubMed是一个免费的MEDLINE数据库,提供生物医学和健康科学领域的文献搜索服务。MEDLINE是当今世界上最权威的文摘类医学文献数据库之一,1996年起向公众开放。而PubMed是互联网上使用最广泛的免费MEDLINE检索工具,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的一个基于WEB的生物医学信息检索系统,也是NCBI Entrez数据库查询系统中的一个。PubMed数据库包含超过3200万篇生物医学文献和摘要。不提供期刊文章的全文,但是通常会附有指向全文的链接。PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘,可与提供原文的网址链接,提供检索词自动转换匹配,操作简便、快捷。。
数据库
PubMed的数据主要来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied bypublisher等。数据类型:期刊、综述、以及与其它数据库链接。与MEDLINE数据库相比,PubMed具有收录范围更广、界面更友好、文献报道速度快等优点。
MEDLINE收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献1600万余条书目数据(2005年数据),记录的标记为[PubMed-indexed for MEDLINE]。这些数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊,近年数据涉及30多个语种,回溯至1966年的数据涉及40多个语种,90%左右为英文文献,70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。
In Process Citations:1996年8月开始,每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据,该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-in process]。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时,每星期转入MedLine一次,而被处理前的数据从该数据库中删除。
OLDMEDLINE:含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要,记录的标记为:[PubMed-OLDMEDLINEfor Pre1966]。
Publisher-SuppliedCitations (Articles Not in MEDLINE or IN Process):是由出版商提供的电子文献,每条记录标有[PubMed – as supplied by publisher]。这些文献包括两种来源: MEDLINE收录范围的文献,每日被添加到InProcess Citation中去,换上[PubMed – in process]的标记,并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI;不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。
服务项目
检索方法
PubMed的检索方式有基本检索、高级检索、主题词检索、期刊检索、临床查询、单篇引文匹配等,最核心的检索技术是自动语词匹配。
1、布尔逻辑检索
语句:AND OR NOT
直接输入多个单词,默认空格为AND,如diabetes HbA1c
复杂运算则AND不能省略(HbA1c OR IGT)AND diabetes
运算符大小不忌,默认顺序从左到右,可用括号改变顺序diabetes and(HbA1c OR IGT)
2、字段限定
1)正确格式:检索词[字段名]
如diabetes[TI]
2)[AU]著者检索构词规则:姓全称在前,名首字母在后
如张三——ZhangS
3)2002年后录入作者全名,字段名为[FAU]
Steven R Smith[FAU]
4)短语检索
“”精确检索,不改变顺序与位置。完全按“”内的内容检索
5)截词检索
*多放单词后方,如retrie*包含retrie在内的所有单词,如retrieve、retrieval
6)自动语词匹配:
系统对输入的检索词,会进行自动语词匹配处理,努力实现检索词的最大语义转换,转换结果会在detail中显示
转换遵循以下三个规则
1)对于输入检索框的检索词,系统首先在多个转换表(MeSH主题词、刊名、作者转换表)中进行搜索比对,并自动转换为相应的主题词、著者、刊名。如输入new england journal of medicine,将自动转换为”N Engl JMed”[Journal];输入vitamin h,将自动转换为”biotin”[MeSH Terms]
2)再将检索词在全部字段(all fields)中进行检索,并执行OR布尔逻辑运算。如输入vitamin h,将自动转换为”biotin”[MeSH Terms]OR ”biotin” [All Fields] OR “vitamin h” [All Fields]
3)若输入多个检索词或短语词组,系统会继续将其拆分为单词后按照1和2分别进行检索,单词之间布尔逻辑运算为AND。输入single cell,将自动转换为(”single person”[MeSH Terms] OR “single”[All Fields] OR “person” [All Fields] OR “single person” [All Fields] OR“single” [All Fields]) AND (“cells”[MeSH Terms] OR ”cells” [All Fields] OR“cells” [All Fields] OR “cell” [All Fields])
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物 学数据,序列中心的数据等等。PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
检索注意事项:
检索汉化
汉化,让中国的PubMed使用者尽量多的看到、使用自己更为熟悉的、美丽的中文。高级检索页面进行了汉化。检索关键词进行了汉化提示。网络词典集成检索结果页面集成了根据
北京金叶天盛科技有限公司著名产品《
新编全医药学大词典特点
第三方PubMed
GoPubmed
GoPubMed是德国2006年创建2008年成熟推出对PubMed进行语义智能检索、分类导航和深度开发的体现崭新思维的网络检索工具,也是一种对检索结果进行多维统计分析的软件.通过它用户可以节省90%以上的网上搜索时间.检索者可以很快了解检索到文献的概貌和该研究领域的研究态势,如论文作者的研究轨迹、论文的年度分布、全球核心作者及核心期刊、合著者可视化关系网络图以及作者分布世界地图等等.
PubMed-cn
PubMed-cn为丁香园旗下网站,专业的医学文献数据库,其数据每天与美国的NCBI数据中心同步一次。用户在检索文献时,可以立即看到该文献影响因子;用户可以在期刊数据库查询影响因子变化趋势、投稿指南、投稿经验等相关的信息。并且PubMed-cn提供
国家自然科学基金查询,分析各个地区中标率,热门学科,是申请NSFC的好帮手。