《中国兽医菌种目录》是2008年中国农业科学技术出版社出版的图书，作者是中国兽医药品监察所，中国兽医微生物菌种保藏管理中心

兽医微生物资源是生物多样性的重要组成部分，它与科学、教育、国民经济、国防、人类健康和动物卫生关系密切，在畜牧业的发展、动物疫病的防治、公共卫生、食品安全评价、对外贸易以及科学教育等方面发挥着重要的作用。

为了更好地挖掘和利用这些微生物资源，本着资源共享，充分利用的原则，对该中心及其所属分中心保藏的兽医微生物菌种进行了认真的整理和编撰，在《中国兽医菌种目录》2002年版的基础上，进行了增删和修订，编辑出版了《中国兽医菌种目录》2007年版。本目录共收录225种（群）2238株，将2002年版目录纳入种（群）的细胞系作为附录编辑。本目录内容丰富，资料翔实，为从事畜牧兽医科研、教学、生产、检验及其他相关领域的工作者提供了更多的兽医微生物资源信息。

本目录是在国家科学技术部科技基础工作专项资金的资助下出版的。

细菌

支原体

衣原体和立克次体

原虫

病毒

附录1　细胞系

附录2　细菌培养基

附录3　细胞培养基及试剂

附录4　菌株名称（拉丁文中文名称对照）索引

附录5　菌株编号索引