9岁的胜允有一个事事紧张的妈妈，妈妈总是在想如何让自己孩子更加强，如果比其他小朋友更出色，是否该让他念更好的学校不断烦恼着。妈妈甚至要求孩子在家也用英语对话，却不知道自己孩子真正的兴趣和特长是什么，在一旁看到妻子过分紧张儿子成长的爸爸也感无奈，除了偶尔抽时间和儿子多玩玩以外，也没有其他办法。
素食主义者朱熏到胜允妈妈工作的新公司上班，一直酒量不好的他为了迎合职场生活，不断地跟随同事们到外吃喝玩乐，却没人看到他无法说出口的无奈，如此努力迎合身边人的朱熏却因不够活泼被同事们歧视，灰心的他有一次在
楼梯间看到一女同事独自落幕地抽烟，更发现不合群的可悲。
大家眼里看上去非常羡慕的朴科长，因为有钱早早就把女儿送到国外去念书，妻子也一同陪伴在国外，每次女儿回来都让他在同事面前炫耀一番，可是大家却不知道一个人生活的他，回到家里是如此孤独，所以一个星期总宴请下属们吃饭，填补回家一个人的孤寂。由于女儿长期在外国，连好不容易回一次家，女儿都不愿意和爸爸睡觉。
朴科长的爸妈是已结婚50年的老夫老妻，因为爸爸退休了每天在家游手好闲，除了想想办法每天对妻子有新要求和提出不满外，没有什么事让他觉得自己有存在感，却突然收到妻子的法院信，因为实在忍受不了这样生活的妻子要求离婚...
《飞吧企鹅》是曾制作短片《视线》系列的韩国国家人权委员会第一次制作长篇电影，关注现代社会中人们千差万别的“差异”，主张沟通和尊重这些差异去构筑更美好的明天。影片采取了真人表演动画作结合的方式，通过生活中各种常见小事指出人权问题。讨厌上学想变成企鹅的小学生、总是挨欺负的素食主义者、时刻要察言观色的上班族、和妻儿分离的“雁子爸爸”和只想过自己人生的妻子……影片的故事都取自实际生活中的片断，人物也如同是身边的亲朋戚友，令观众有“我们大家都是企鹅”的共感。演员们极具真实感的演技展现了生活中最司空见惯的烦恼，让观众测量自己生活的幸福指数有几分。生活中很不起眼的小细节也能反映人权问题，影片通过这些有趣的小故事来提醒观众增长自己的人权意识，催促人人们各自纠正“习惯性错误”。不再是严肃的“人权申诉”，和片名一样，《飞吧企鹅》全片散发着温暖幽默的情感。
导演
林顺礼最为人熟知的作品是票房不俗的体育片
《我人生最辉煌的瞬间》，这次他二度与
文素丽合作。后者也再次与
朴元尚在片中演夫妻。文素丽扮演的“教育妈妈”角色，把几乎所有人生的期待都倾注在9岁的儿子的教育上。林顺礼表示听到“人权问题”四字，人们就容易心情郁闷沉重起来，他尝试用“最大限度接近快乐”的方式来表达这个并不轻松的主题。他承认在当今华丽视觉和剧本占主流市场的商业电影世界中的，拍人权电影是件“容易吃力不讨好的事情”。为了经济的价值储蓄和成功不断向前奔跑着的人们，“共存”是不得不面对的问题。这部影片或许会令观众胸中感到切身的疼，不过颇具心思的幽默也可以化解这些不安和沉重。