建校以来，学校经历了一段不平凡的办学历程：1998年，始建
中原中学初中部；2001年，与原殷行一小合并，组建九年一贯制学校，更名为中原实验学校；2005年，杨浦区人民政府和
上海音乐学院签署合作办学协议，学校再次更名为上音杨浦学校。2009年，杨浦区人民政府与上海音乐学院深化合作，学校搬迁新校区，更名为上海音乐学院实验学校。2012年9月学校与
东升中学合并，实现一校两址办学，学校在一次次的更名中实现着自我超越与发展。
学校坚持“基础厚实、艺术见长”的办学理念，重视内涵建设，努力建设“求真、务实、尚美、崇德”的校风、“教有所长、善思躬行”的教风和“学有所长、勤思笃行”的学风，始终保持着优异的办学质量和良好的社会声誉。2005年，满载着领导的关怀和社会的期盼，上音杨浦学校挂牌成立，我们依托高校这一资源平台，发展以
民乐、管乐为特色的艺术教育，打造以音乐为主体、多元艺术相结合的办学特色，使学生在“涵养高雅性情，感悟美好人生”中提高艺术修养、形成健康人格、促进全面发展。
小学一年级到五年级有300名学生在学习民乐，每个年级都建立了一支民乐队。中学六年级到八年级共有近400名学生在学习管乐，共组建了一支校管乐队和三支年级管乐队，学习器乐的学生占学校学生总数的一半。2010年我们又分别在一年级、六年级开设了声乐专业，有近二百名孩子开始接受训练。
2018年6月10日，上海音乐学院实验学校等15所中小学被授牌为 “上海市中小学非通用语学习计划项目实践基地”。2014年，上海市教委启动了上海市中小学非通用语种学习计划项目，并委托上海外国语大学具体实施。在
上海外国语大学的全力支持下，现已开设意大利语、葡萄牙语、土耳其语、希伯来语、瑞典语、希腊语、泰语、阿拉伯语、波斯语等9个语种课程18个教学班。
近年来，学校先后荣获上海市安全文明校园、上海市艺术特色学校、杨浦区精神文明单位、杨浦区科技特色学校，杨浦区拥军优属先进集体，杨浦区见习教师规范化培训基地学校，杨浦区教育系统办学先进单位等荣誉。