东北抗联军的主力部队之一。1937年10月，由东北抗日联军独立师改编而成。军长祁致中，政治部主任金正国。下辖1个师3个旅，共约2500人。主要活动于桦川、同江、勃利、抚远、富锦等地。1939年5月，编入东北抗日联军第三路军。1940年春，随第三路军编成支队，在黑嫩平原坚持游击战争。后转移至中苏边境整训。1942年8月编入东北抗日联军教导旅。该军在桦川等10余县坚持抗战十余年，作战数百次，歼灭日伪军数千人。

1933年6月，吉林省桦川县（今属黑龙江省）驼腰子金矿工人祁致中（又名祁宝堂）率领矿工暴动，成立东北山林义勇军，又称“明山队”，进行抗日活动。1935年9月，“明山队”接受中国共产党领导，编为东北人民革命第3军方（正）依（兰）游击团。1936年5月，游击团改编为东北抗日联军独立师，辖3个旅，共400余人。1937年，独立师进行了来财河、五道岗等十余次战斗，同时创建了七星砬子兵工厂等后方基地。10月，独立师改编为东北抗日联军第11军，祁致中任军长，金正国任政治部主任，辖第1师（3个旅），共1500余人，分别活动在依兰、桦川、富锦等地区。1938年，由于日伪军“讨伐”，使七星砬子后方基地遭到破坏，部队损失严重。12月，第11军2个旅90余人随同抗联第3、第6、第9军西征，转战到铁力、海伦地区。1939年5月，编入东北抗日联军第3路军。6月中旬，留守在下江地区的第3旅200余人在富锦县南部与日伪军500余人遭遇，激战中，旅长姜宝林等大部牺牲；余部在参谋长单洪福率领下继续坚持斗争，至1940年春亦全部牺牲。

东北抗日联军第11军的前身为东北山林义勇军。1933年2月桦川县驼腰子金矿工人祁致中带领6名工人举行暴动，打死护矿日军7名，夺取轻机枪1挺，手枪和步枪7支，并号召矿工参加暴动队伍，很快就有20多名青年矿工入队。暴动队伍以桦南县大梨沟为根据地，正式成立了以祁致中为首领的东北山林义勇军，拉起了抗日的大旗。1935年2月祁致中带领东北山林义勇军进入方正县境内，与赵尚志、冯仲云领导的东北人民革命军第3军取得了联系，主动接受第3军领导，在第3军的帮助下，祁致中的东北山林义勇军政治素质和战斗力有很大提高。1936年1月28日，中共勃利县委看到祁致中部已达到100余人，已成为一支重要的抗日力量，派共产党员勃利县团委书记富振声去祁致中部工作，帮助改造这支部队。1936年5月20日在依兰县二道河子，祁致中部被改编为东北抗日联军第3军独立师。师长祁致中，政治部主任富振声，指导部主任金正国。独立师成立后经过整顿发展，先后建立了3个旅，共800余人。1937年6月15日富锦县警察大队大队长李景荫率部起义，加入独立师，李景荫任师参谋长。同月中共北满省委做出决定，将东北抗日联军第3军独立师扩编为东北抗日联军第11军。1937年11月，在东北抗日联军北满总指挥部总政治部主任李兆麟的帮助下，东北抗日联军第11军在富锦县二区成立。军长祁致中，政治部主任金正国。11军下辖1个师，师长李景荫。11军有1500多人，在富锦、桦川、依兰和同江一带开展游击战争，打击日伪军。1939年5月30日，11军编入抗联第3路军建制。1940年4月，第3路军取消军一级建制，11军分别编入抗联第3路军3支队和9支队，11军番号取消。