中交第三航务工程勘察设计院有限公司（原中交第三航务工程勘察设计院，以下简称三航院）是中国最大的交通、港口工程勘察设计单位之一，上海市高新技术企业。具有国家颁发的工程咨询、勘察、设计、总承包和工程造价等甲级资质证书。

2005年获得建设部建筑工程设计甲级资质和商务部授予的对外承包工程经营权。1992年以来一直被国家建设部评为“中国勘察设计综合实力百强单位”。2005年、2006年均被美国《ENR》和《建筑时报》联合评为年度“中国工程设计企业60强”，2006年被中国勘察设计协会授予“优秀勘察设计院”荣誉称号。近年来，在继续保持“上海市文明单位”、“中港集团文明企业”荣誉的基础上，又先后荣获“全国交通系统创文明行业先进单位”、“上海市职工最满意企业”等荣誉称号。

三航院专业设置齐全，技术力量雄厚，能独立承担国内外各类港口、航道、海洋工程、物流工程、河川枢纽、修造船厂、公路、桥梁、机场跑道等综合性大型工程项目及供水、输电、环保工程、工业民用建筑、工业计算机自动控制等项目的规划、咨询、勘察、设计、工程监理、工程造价及工程总承包等。三航院配备了先进的计算机辅助设计和科学管理等系统软硬件装备，全套现代化工程勘察设备居国内同行先进之列。

掀开中国水运工程的发展历史，三航院是其中闪亮的一页。自1958年成立以来，三航院在中国境内主要承担了以上海、江苏、浙江及福建为中心，北起辽宁，南至海南以及广东、广西等省市大型综合性港区和物流园区的规划和勘察设计任务，并完成了发电厂、钢铁厂、修造船厂、石油化工厂等百余个大中型企业专业化码头的勘察设计任务。还出色地完成了澳门国际机场、缅甸国际集装箱码头等境外大型交通工程的勘察设计任务。累计完成包括上海国际航运中心洋山深水港区工程在内的大中型勘察设计项目4000余项，已成为国内成就卓著、声誉斐然的工程勘察设计企业。

半个世纪以来，三航院人才辈出，培养和拥有一大批技术精湛、经验丰富的中高级设计勘察人员。三航院实施“科教兴院”和“人才强企”战略，积极营造聚才留人的良好环境，2004年被上海市委、市政府授予“上海市人才工作先进单位”称号。

三航院一贯重视产品质量，视质量为生命，推行全面质量管理。1998年和2003年通过英国劳氏公司的94版和2000版认证。2007年再次通过英国劳氏公司“质量、环境、职业健康安全”体系认证。

至2007年，三航院先后荣获国家及省部级优秀设计、科技进步等奖项共200余项，其中获国家优秀设计金质奖5项、银质奖6项、铜质奖4项；国家优质工程银质奖5项和“中国建筑工程鲁班奖”、“中国土木工程(詹天佑)大奖”7 项。

在全球经济一体化进程中，三航院积极实施“走出去”战略，先后承揽了多项国际工程项目。与日本、美国、德国、英国、挪威、荷兰、法国、葡萄牙、中国香港地区、中国澳门地区等十多个国家和地区的有关公司进行了技术合作和交流；还接受国家有关部门委托，与外国公司合作对世界银行及国外有关银团在中国境内外投资或贷款的十多个大中型工程项目进行了技术评估与审查，具备了国际工程承揽能力。

2006年三航院改制成为中交股份（上市公司）全资子公司，正扬起风帆，以建立现代企业制度为契机，内强管理、外拓市场，向着新的辉煌，向国际知名的国际工程咨询设计公司的目标迈进。

2017年11月，中交第三航务工程勘察设计院有限公司获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第五届全国文明单位”荣誉称号。

2021年8月，中交第三航务工程勘察设计院有限公司规划与产业研究院经济研究室被命名为“第20届全国青年文明号“。