中国科学院上海高等研究院是由中国科学院和上海市人民政府共建的多学科交叉综合性国立科研机构，坐落于中国科学院上海浦东科技园，筹建于2008年，2012年11月通过验收正式成立。

2008年，中国科学院与上海市人民政府根据中国科学院党组（扩大）会议纪要和中国科学院——上海市院市合作协议精神，决定共同筹建中国科学院上海高等研究院。

2009年8月，时任中国科学院副院长江绵恒，上海市市委常委、浦东新区区委书记徐麟共同为中国科学院上海高等研究院（筹）揭牌，研究院入驻张江高科技园区。

2010年12月，研究院正式入驻中国科学院上海浦东科技园。

2012年11月，中国科学院上海高等研究院通过验收并举行揭牌仪式。同年，获批上海市首批“海外高层次人才创新创业基地”。

2013年，中国科学院上海高等研究院学位评定委员会成立。

2015年，上海高等研究院的“中国科学院低碳转化科学与工程重点实验室”通过验收。

2016年，中国全球二氧化碳监测科学实验卫星发射升空，中国科学院上海高等研究院与中科院微小卫星创新研究院、上海科技大学共建上海碳数据与碳评估研究中心，承担碳卫星的数据开发、碳排放天地一体化监测及低碳发展战略研究。

截至2019年9月，全院共有各类人员1015人，全职人员949人，兼职66人。全职专业技术人员851人，正高级145人，副高级283人。

共计236人次获得24类人才项目，其中院士3人、国家“万人计划”入选者4人、“国家杰出青年科学基金”获得者5人、“国家优秀青年科学基金”获得者3人、人社部“百千万人才工程”入选者5人、科技部“中青年科技创新领军人才”3人、“国务院特殊津贴”获得者17人、中科院“特聘研究员”29人、中科院“关键技术人才”5人、上海“领军人才”7人、上海“优秀学术带头人”7人、上海“青年拔尖人才”5人、上海“启明星计划”入选者8人。

国家杰出青年基金获得者：封松林、孙予罕、吴家睿等

据2017年1月研究院官网显示，研究院建成交叉前沿与先进制造技术研究部、信息与电子技术研究部、空间与海洋研究部、能源与环境技术研究部、健康科学与技术研究部5个研究部。

截至2013，研究院在信息与电子技术领域拥有电视信号分析仪、正弦信号源、任意波形发生器、Certify软件、功率器件分析仪、FPGA原型验证板、LTE核心网设备、实时示波器、基带矢量信号发生器、混合信号示波器、无线通信终端综测仪、系统级网络测试仪、EMI接收机、移动测试车、系统测试频谱仪、器件建模软件、Synplify Pro逻辑综合软件、网络测试仪、低频频谱分析仪等仪器设备；在能源与环境技术领域拥有X射线衍射仪、化学吸附仪、燃烧室平台、微型热电联产系统实证平台、一、二级洗气塔、超临界水反应装置、工艺流程模拟软件、Zeta电位分析仪、激光热导仪、通风及控制系统、质谱分析系统、数据采集系统、台式万能材料测试系统等仪器设备；在交叉前沿与先进制造技术领域拥有全自动宽带调谐飞秒振荡激光全固态一体化飞秒再生放大器、飞秒光参量放大器、时间分辨光谱测量系统、显微荧光光谱系统、大型拼接式高阻尼光学隔震台、光学隔震系统、近红外InGaAs CCD、振荡器水冷机、放大器水冷机等仪器设备。

2014年，研究院建立中国科学院仪器设备共享管理平台，新增中测测试机、手动探针台、电感耦合等离子体发射光谱元素分析仪、傅里叶变换红外光谱系统等大型设备，新建及完善大型实验（试验）台架或示范验证平台，包括：三网融合无线系统综合测试平台、智慧城市综合运营管理服务平台、甲烷重整与高温反应系统与平台、合成气制烃醇烯反应系统与平台、CO2加氢催化评价系统与平台、甲醇转化利用评价系统与平台、微藻筛选驯化和应用评价系统、面向新型核电系统的兆瓦级氦气轮机综合试验装置和融盐换热装置、兆瓦级燃气轮机整机试验装置、智能城网综合验证示范平台、生物活组织3D打印制造平台、系统生物学分析技术平台等。

据2017年1月研究院官网显示，研究院拥有Annual Reviews现刊、ACS Journals、AIP Journals、ACM Digital Library、American Society of Plant Biologists、American Society of Neuroradiology、American Society of Health-System Pharmacists、APS Journals、ASA-CSSA-SSSA、American Society of Agricultural and Biological Engineers、American College of Chest Physicians、American Association on Intellectual and Developmental Disabilities、Allen Press、American Institute of Biological Sciences、American College of Physicians、American Society of Nutrition、节能与环保开放社会经济信息集成与服务系统、新材料行业开放社会经济信息集成与服务系统、能源行业开放社会经济信息集成与服务系统、Wiley-Blacwell现刊数据库（非集团刊）、SpringerLink期刊-CLOS、SpringerLink电子图书（含丛书）、中科院机构知识库、Wiley电子图书、RSC电子图书、SpringerLink期刊-RLOS、中科院古籍数据库、Elsevier回溯、CNKI科技类博硕士学位论文数据库、Cambridge Journals回溯、IOP电子图书、全院统一自动化数据库、Springer Protocols（1980-2012）、中国科学院学位论文服务系统、Digital Library of MIT Theses、联合西文期刊篇名目次库、中国数学文献数据库、全国期刊联合目录数据库、NSCEP、CSA-COS Pivot、Nature（1869-1986）、Turpion回溯数据库、IOP（1874－2002）、Project HOPE Journal、University of Toronto Press、SpringerLink回溯数据库、Royal Society of Medicine、Computing Reviews、Rapra Technology Limited、Royal Society、Multi-Science Publishing Co Ltd、Mary Ann Liebert, Inc、Maney Publishing、Radiological Society of North America、IOS Press Journals、中国资讯行搜数网、Cold Spring Harbor Laboratory Press、CSA-PapersInvited、CSA-CSA Illustrata: Technology、Future Science、White Horse Press、CSA-CSA Illustrata: Natural Sciences、CSIRO Journals、University of Chicago Press、NRC Research Press、GeoScienceWorld、Frontiers in China系列期刊、Botanical Society of America、Berkeley Electronic Press、IGI Global、Ecological Society of America、Canadian Institute of Forestry、Beech Tree Publishing、NetLibrary电子图书、Faculty of 1000、Ei Engineering Village 2、ScienceChina、ISI Highlycited.com、ISI Essential Science Indicators、ISI Current Contents Connect、ISI BP、SpringerLink-Landolt-Bornstein、ISI Century of Science、ISI Derwent Innovations Index、ISI Proceedings、ISI Medline、ISI Web Of Science-Science Citation Index Expanded、ISI INSPEC、SPIE Digital Library、Oxford University Press、Nature（1987-1996）、JSTOR、ProQuest Dissertations & Theses B、方正中文电子图书、SpringerLink期刊、RSC、ProQuest Dissertations & Theses 全文数据库、Nature+NSJ、Science Online、PNAS美国科学院院报、IEEE/IEE Electronic library、CNKI科技类期刊数据库、Wiley-Blacwell现刊数据库（集团刊）、IOP Electronic Journals、Elsevier ScienceDirect、Cell Press、Cambridge Journals现刊等数据库资源。

截至2015年12月，研究院共获得国家发明专利102项、实用新型专利26项、外观设计专利1项，《一种用于制备氯乙烯的催化剂及其制备方法及其用途》获得国际专利。

2009年11月，“SZ-7飞船伴随卫星”项目在中国国际工业博览会上获得了创新奖。

2013年，上海高研院共有在研项目289项（包括新增项目127项），其中，承担国家重大科技专项课题2项，主持（或承担）国家重点基础研究发展计划（973计划）和国家重大科学研究计划项目1项､承担（或参加）课题5项（新增2项），主持（或承担）国家自然科学基金面上项目13项（新增5项），主持（或承担）中国科学院战略性先导科技专项课题10项，主持（或承担）院重点部署项目2项（新增1项），共发表论文245篇。其中126篇SCI文章，累计申请专利109件，获得专利20项。

2014年，上海高研院共有在研项目356项（包括新增项目145项），其中，承担国家重大科技专项课题3项（新增1项），主持（或承担）国家重点基础研究发展计划（973计划）和国家重大科学研究计划项目1项、承担（或参加）课题5项，承担（或参加）国家高技术研究发展计划（863计划）课题6项（新增1项），承担（或参加）国家科技支撑计划项目课题3项，主持（或承担）国家自然科学基金重点国际（地区）合作研究项目1项（新增1项）、面上项目18项（新增4项）、青年基金项目42项（新增12项），主持（或承担）中国科学院战略性先导科技专项课题12项，主持（或承担）院重点部署项目4项（新增2项）、中科院科研装备研制项目1项（新增1项），承担重点国际合作项目2项，承担中科院院地合作项目10项，承担上海市科委院地合作专项13个（新增4项），承担横向项目142项目（新增75项）。共发表论文240篇，其中在Phys.Rev.Lett.，Adv.Func.Mater.，J.Power Sources，Nanoscale等期刊发表SCI论文120篇，累计申请专利115件，获得授权发明专利47项。

2015年，研究院共发表论文188篇，其中在包括Nature等顶尖期刊上发表SCI论文152篇。共有在研项目376项（包括新增项目146项）。其中，承担国家重大科技专项课题3项，主持973计划和国家重大科学研究计划项目1项、承担（或参加）课题5项，承担（或参加）863计划课题5项（新增3项），承担国家科技支撑计划项目课题3项；主持国家自然科学基金重点国际合作研究项目1项、新增国家基金委重大研究计划培育项目1项、新增国家基金委联合基金项目培育项目1项、面上项目21项（新增4项）、青年基金项目43项（新增10项）；主持中国科学院战略性先导科技专项课题12项，主持院重点部署项目4项、院科研装备研制项目2项（新增1项）；承担重点国际合作项目2项；承担上海市科委院地合作专项17个（新增4项）；承担横向项目121项目（新增54项）。

据研究院2017年研究生招生简章、中国科学院2016年鉴显示，研究院设有一级学科博士点4个、二级学科博士点8个、一级学科硕士点4个、二级学科硕士点7个、专业硕士点3个。

一级学科博士点：电子科学与技术、通信与信息工程、化学、化学工程与技术

二级学科博士点：有机化学、物理化学、微电子学与固体电子学、电路与系统、通信与信息系统、信号与信息处理、生物化工、化学工程

一级学科硕士点：电子科学与技术、通信与信息工程、化学、化学工程与技术

二级学科硕士点：有机化学、物理化学、微电子学与固体电子学、电路与系统、通信与信息系统、信号与信息处理、生物化工

专业硕士点：化学工程、电子与通信工程、生物工程

截至2015年底，上海高研院共有在学研究生375 人，其中硕士生322人、博士生53 人。

中国科学院大学招收的博士学位研究生实行学分制和弹性学制，博士生基本学制一般为3年，最长修读年限（含休学）不得超过6年。

学术型硕士生和全日制专业学位硕士研究生基本学习年限均为3年，最长修读年限（含休学）不得超过4年。全日制专业学位硕士研究生不得进行硕博连读，但可以在毕业时作为应届毕业硕士生参加博士研究生的普通招考。

通过直接攻博方式招收的博士生，基本学制一般为5年，最长修读年限（含休学）不得超过8年。推荐免试硕士研究生基本学制一般为3年，最长修读年限（含休学）不得超过4年。通过硕博连读方式招收的博士生，包括硕士阶段在内修读年限一般为5年，最长修读年限（含休学）不得超过8年。

据2017年1月研究院官网显示，高研院研究生奖助学金由国家助学金、国家奖学金、中科院奖学金、国科大学业奖学金、研究院奖学金、助研助管岗位津贴、高研院社会奖学金七部分组成。奖助学金按照博士研究生和硕士研究生两个层次分别设立。

研究生奖助学金发放对象为高研院正式学籍注册的全日制在读博士、硕士研究生，硕博连读生按学籍注册类别对待。高研院与上海大学、上海科技大学联合培养研究生参照享受奖助学金特殊补贴及助研助管岗位津贴部分。

在2015年壳牌博士创新奖评选中，研究院研究生3人获得一等奖、3人获得优秀奖。

在中国科学院大学2015-2016学年优秀学生评选中，35人获得三好学生、4人获得优秀学生干部、1人获得国科大优秀毕业生、2人获得三好学生标兵候选人、3人获得上海市优秀毕业生候选人。

2015年11月，研究院研究生2人获得国家奖学金。

截至2016年11月，研究院与上海电气、英国石油公司（BP）、荷兰皇家壳牌公司（Shell）、美国西北太平洋国家实验室（PNNL）、法国道达尔集团（TOTAL）、英国诺丁汉大学、华盛顿大学等多家国内外知名跨国公司、研究机构和大学签署了联合研发协议，通过成立前瞻研究基金、联合实验室、联合技术开发或技术公司等方式，实现共性技术的研发与集成。

2020年12月，入选2019-2020年节约型公共机构示范单位名单。

2022年1月30日，入选2021-2025年全国科普教育基地第一批拟认定公示名单。

2022年5月，中国科学院上海高等研究院软X射线自由电子激光攻关青年团队被授予第26届中国青年五四奖章。

院徽上半环是高研院的中文名称：中国科学院上海高等研究院；下半环是高研院的英文名称：SHANGHAI ADVANCED RESEARCH INSTITUTE，CAS （CAS是中国科学院的英文名称的缩写）。

院徽环内是六个晶体组成的一个物质结构图案（象征数学、物理、化学、天文、地学、生物六大学科融汇和结合的基础作用），延续了中国科学院院徽的元素，清晰地表明了上海高等研究院与中国科学院的血缘关系。

院徽中心的图案是上海市市花——白玉兰，代表上海高等研究院是中国科学院与上海市合作共建的国立科研机构。

院徽的主色调为孔雀蓝色。

核心文化：上善若水、海纳百川、协力创新、同赢未来

科技价值观：以创新为民为宗旨，以科教兴国为己任

“创新文化节”是研究院传统文体系列活动，每年秋季举办，每届活动历时2个月，研究所全员参与。

研究院举办了中华青铜鼎文化讲坛、中华美食文化讲坛等文化讲坛和新年联欢会等文艺活动。

研究院成立了文体联合会和研究生会，组建了读书协会、摄影协会、旅游协会、足球队、篮球队、排球队、乒乓球队、羽毛球队、绳毽队。