中央军校教导总队顾名思义就是隶属于中央军校的教导部队，教导部队在国军军队中有一种示范性质。

1930年5月，中央军校编成一支两旅六团制的教导第2师，是早期教导部队的极盛期。这个教导师将所有军校的新锐武器都编进去，其特种兵有2个炮兵团（即军校的2个教导炮兵团），再加上骑兵连、工兵连、辎重连、学兵营与战车队，可谓精锐尽出。在中央军之中战力仅次于冯轶裴的教导第1师。教2师战后改为著名的第4师。

在中原大战结束之后，军校以德国顾问的规划开始编组教导总队，这个总队成立于1931年1月，最初编制两个步兵营及炮兵连、工兵连、骑兵连、迫炮连、特务连及通信连。部队由原教二师特务营、炮兵团、工兵团、骑兵团各一部、军校卫兵队抽出考编。

这个团级部队主要用于德式步兵团编装之试验以及新武器的研究。总队长唐光霁少将为保定军校毕业的原西北军军官，擅长训练，北伐之后在中央军校任职。总队附朱宗海为炮兵教官，张铎为原教二师的参谋处处长，主持总队的参谋业务。两个步兵营规模不大，而且缺乏实战经验，主要用于编装实验；炮兵连操作德造博福斯山炮；工兵连以新配器械演练架桥、筑城、爆破（铁材、木材及混凝土之各种类型）；骑兵连逐渐操作机踏车辆；通信连以有线电之布设为主。

三月，总队长改为朱宗海上校。九月，改为保定六期毕业的高级教官章履和少将。在此期间这支部队都只是纯示范性的实验部队。

六月，总队长改为桂永清少将。桂氏到任之后立即发挥其著名之组织长才，大力扩编教导总队成为一支野战部队。桂氏首先编出1个完整的司令部，两位总队副周振强与张坤生都是其军校1期同学，参谋处（主任温祖诠）、副官处（主任张炳东、金声）与经理处（主任王汉英）一应俱全。部队则改为第1团，辖步兵3营、步榴炮连及通信连，团长周振强。总队直辖军士营、特务连、骑兵连、工兵连、通信军士连、军官教育队、卫生队、军乐排、汽车队。总队编制完成之后调防孝陵卫，再度成为正式的战列部队。

总队扩为三团制，参谋长为符昭鶱。辖第1团周振强、第2团胡启儒、第3团张坤生（后易马威龙）、军士营、炮兵营、骑兵营、工兵连、通讯连、特务连、37高炮连、自动车队、卫生队、军官教育总队、军乐排、修械所，并列为1935年第1期整训部队。

西安事变教导总队初试啼声，整整1年之后这支众所公认国军最精锐的部队在长江边全军覆没，回顾前史，能无浩叹。

教导总队自南京撤退之后，即转往武汉整训，陆续收容流散官兵，新募人员，以原本储于后方仓库的武器装配新兵。在沪战时原本有一个系出湘军两旅四团制的第46师损失太重，残部拨入第11师与第61师之后师部到湖南整编。

教导总队的第一仗是西安事变时的渭南战役。1936年12月13日消息传到南京时，教导总队正在举行运动会，总队长桂永清将军宣布停会，召集全体官兵宣布消息，全总队营长以上军官集体要求进攻西安。15日，教导总队就在南京煤炭港上车，开赴郑州。17日到华阳。18日，教导总队步行到渭南东乡。

12月19日凌晨9时，教导总队向渭南攻击前进，炮兵向渭南后方延伸射击，破坏第107师后方交通线，交辎学校战车营战车在第一线展开，掩护教导总队第1团与第2团进攻渭南，骑兵团侧翼推进迂回。上午9时攻占渭南县城，叛军向西安退走。此役总队阵亡士兵39员，负伤50余员。何应钦接报后急电桂总队长事变可盼和平解决，教导总队于是兵屯渭南。这是教导总队及战车营的第1仗。抗战军兴，教导总队由副总队长周振强率领参加淞沪会战。周振强以一个团攻击公大纱厂日军阵地，该团猛攻3日伤亡过半，调到南京整补。

桂永清当时正在英国参加英王加冕，闻讯急忙回国。九月桂永清返抵国门，晋见何应钦上将，何上将谕知桂氏将调教导总队入川扩编成为第二期准备军，固守长江上游。桂永清返回总队之后召集营长以上官佐开会，慷慨陈词：“摆在我们面前有两条路，一是到后方扩军，大家升官，我升集团军总司令，你们营长升团长，团长升师长，旅长升军长。另一条是到前方作战牺牲。长期以来，其它部队拿国难薪，只有我们拿全薪，论装备我们是全新德式。1937年全国部队纷纷请缨参战，我们却到后方扩编，虽属命令，扪心自问，能无愧疚吗。”别人一定说我们怕死畏战。养兵千日用在一朝，我（1937年）请各位表决……”。结果全体军官一致要求上火线。桂总队长马上报告蒋委员长及何应钦部长，蒋介石乃将总队1个团调到湖南扩建，总队主力调入淞沪战场。

11月6日总队到达上海，直接投入苏州河畔八字桥阵地接替第1军阵地，桂永清与参谋长邱清泉均在第一线巡视，教导总队死守阵地，日军敌前以橡皮艇强渡，被杀的血染河水。直到11日金山卫被突破消息传来，总队才奉命撤退。教导总队原本奉命直接撤到湖南，结果唐生智找何应钦吵架，吵到蒋介石面前，硬是将教导总队留在南京。12月7日，日军攻抵南京光华门前，教导总队奋起抵抗。8日守军第2团吴幼元营长被日军空袭重伤，第2团团长谢承瑞亲临督战。桂总队长闻讯，亲率医官到光华门火线救护吴营长，并要求第二团官兵效法岳家军精神，不为日寇捍动。教导总队主战场在紫金山，守军营长阵亡5员，伤亡殆尽。第5团邓文僖团长退出紫金山之后率部坚守最后阵地天堡城，桂总队长亲到天堡城督战，宣称与阵地共存亡。左右皆劝桂将军撤离，桂将军坚决不肯。

12月11日下午6时，唐生智召集守军各部队长，下令撤退。桂永清离开阵地赴会，会议结束之后桂氏派人通知各团长撤退，自己就先前往下关渡江。这是大家争议很久的桂氏临阵脱逃的说法。其实桂氏亦坚持到最后一天，部队由团长掌握撤退亦在情理之中，桂将军可能也不知道撤退会如此惨烈。

一月，军政部就以第46师师部及少量官兵与教导总队合编，成为新的第46师。

第46师师长原为戴嗣夏，此后即调军政系统，抗战时累官到军训部东南区督训处中将处长，1946年3月退役，1951年4月镇反中被处决。第46师原本已有一定之中央化，副师长为军校1期的孙常钧，参谋长为四期的黄华国。而第46师原来的官佐水平甚高，戴将军本身是保定九期、陆大九期之高材生。他底下的旅、团长也多是保定同窗，素质整齐。一月合编之后师长改为桂永清，副师长李良荣（原航校特务团团长）、周振强。2月桂永清升任第27军军长，师长由李良荣将军递补（标准的连升三级），所属第136旅旅长鲁渭平（保定一期、陆大特四期）、李昌会；第137旅旅长曹典江（保定三期）、李蔼堂均为老第46师班底；由马威龙将军率领的第138旅则为原教导总队。

第46师整训近半月，稍复元气即开往兰封作战，伤亡5000余员，旅长殉职一员重伤两员。战后桂永清、李良荣均免职，第27军番号撤销。第46师只剩三千残兵，往昔宣赫一时的教导总队基本上已经消失了。第46师的残部以同学关系跟着胡宗南西撤，所以理所当然地由胡宗南整编。1938年11月正式委胡系将领黄祖勋将军为师长，辖第136旅王翰卿、第138旅王隆玑。后来跟着刘进第27军到太行山打游击，颇为狼狈。1944年1月纳入第57军。12月第57军空运沾益。1945年2月华南国军整编，第57军裁撤，第46师也随之裁撤，充编第8师，成了第54军的一部份。教导总队至此完全终结。

在作战期间，教导总队奉军政部命令扩为三旅六团制甲种师。教导总队此时已有的三个团完全是德械装备与编装，步兵团有三个步兵营以及第十连（步榴炮连。编有IG18-75轻步兵炮，三排六门。射程5400m），第11连战防炮连（47奥造平射炮），第12连通信连，第13连输送连（次序或有误）。步兵营辖步兵三连、重机枪连、82炮排及通信排。总队原本即储藏大量装备，所以扩编的六个团有三个团以干部在后方整训，仅三团参战。

总队在南京战役时序列如下：

总队长桂永清中将，副总队长周振强少将，参谋长邱清泉少将，参谋处万成渠上校 （余不详）

第1旅，旅长周振强少将，参谋主任马连桂中校

第1团，团长秦士铨上校（后易周石泉中校）

第2团，团长谢承瑞上校

第2旅，旅长胡启儒少将，参谋主任廖耀湘中校

第3团，团长李西开上校

第6团，团长刘子淑上校

第3旅旅长马威龙少将

第4团，团长睢友兰上校

第5团，团长马威龙少将（兼）（后易邓文僖上校）

炮兵团，团长楼迪善少将

工兵团，团长杨厚彩少将

辎重团

骑兵团

通信营、军士营、特务营、兵工连、小炮连（连长严开运少校）

其中第一、三、五团即为德械步兵团，第二、四、六团也赶在南京战役时参战，损失甚大。第二团团长谢承瑞殉职（谢上校系法国炮校与兵工大学之高材生，殉国后追授少将军衔）。