中山大学自然灾害研究中心依托原地球与环境科学学院成立于1992年，首任中心主任为气象学家梁必骐教授。2007年9月学校再次认定并重组自然灾害研究中心，直属学校一级研究中心，挂靠地理科学与规划学院，由学院院长、校长助理保继刚教授兼任中心主任。

中心整合全校优质科研资源，主要从事自然灾害监测预警、预测预报、风险评估、灾害防御和应急管理的科学研究、技术开发与高层次人才培养。现有三个主要研究方向和一个技术支撑平台，包括水灾害防御与应急管理、气象灾害预警预报、地质灾害监测及风险评估、基于GIS遥感的自然灾害研究与开发支撑平台，中心还拥有水灾害和水利信息化联合实验室和中小尺度暴雨实验室。

中心自成立以来，承担了一批国家和省部级研究课题以及为地方经济建设服务的项目，取得了一批高水平研究成果，其中在元胞自动机与地理模拟研究、新一代流域洪水预报方法、分布式物理水文模型、多普勒雷达降雨定量估算技术、水库优化调度、泥石流危险度和风险评价、华南地区台风数值模拟等方面达到国内领先或国际先进水平，开发的广州市三防决策支持系统、广州市多普勒雷达流域降雨定量预报系统、惠州市水资源管理信息系统、数值天气预报业务系统等在实际应用中发挥了较大作用，已成为华南地区自然灾害教学、研究、咨询与系统开发的重要力量。