乔瓦尼·波吉亚（Giovanni Borgia，1476?-1497），甘迪亚公爵，是罗马教皇亚历山大六世的私生子和凯撒·波吉亚、卢克雷齐娅·波吉亚、杰弗里·波吉亚的兄弟。1497年6月14日，死于谋杀。

乔瓦尼，又称胡安（Juan）或琼（Joan），他是亚历山大六世与情妇瓦诺莎·卡塔内（Vannozza dei Cattanei，1442-1518）的四个孩子中的第二个孩子。目前还不清楚乔瓦尼是出生在1474年还是1476年，他曾长期被认为是亚历山大和瓦诺莎的长子。但现代历史学家，基本赞同他最有可能在1476年出生，比他的兄弟凯撒·波吉亚年轻。

乔瓦尼·波吉亚可能出生在罗马，当时罗德里戈·波吉亚（后来成为亚历山大六世）还是红衣主教，并且他的情妇瓦诺莎已经嫁给了多梅尼科·达·Rignano（Domenico da Rignano）。

1493年，他继承了同父异母的哥哥路易吉·波吉亚（Pier Luigi de Borgia）的公国，并娶了路易吉的未婚妻，玛丽亚·恩里克斯·德·卢纳（Maria Enriquez de Luna），成为了第二任甘迪亚公爵，塞萨公爵（Duke of Sessa），那不勒斯（又称为：拿波里）治安官，圣彼得的总督（Governor of St. Peter's）、行政长官和教会军的统帅。

1497年6月14日晚上，他被可怕地谋杀了，在后来成为罗马犹太人区的德拉德卡广场的附近。据推测，是他的兄弟凯撒·波吉亚谋杀了他，因为凯撒是他死后的最大获益者；然而，也有另一种传言，是他的弟弟杰弗里·波吉亚谋杀了他，因为乔瓦尼和杰弗里的妻子桑查（Sancia）有着非同寻常的关系，导致兄弟公开敌对。

乔瓦尼的尸体被发现在台伯河中，腰带上的钱包中里有封不动的30个达科特金币（golden ducats）。他的随从也被杀害，所以并没有目击证人。

乔瓦尼和玛丽亚有两个孩子：“胡安·德·波吉亚-恩里克斯（Juan de Borja y Enriquez，即胡安·波吉亚），成为第三代甘迪亚公爵；和弗朗西斯卡·德·赫苏斯·波吉亚（Francisca de Jesus Borja），成为一个修女，在巴利亚多利德修道院。”这第二位胡安，是圣弗兰西斯（Saint Francis）的父亲。圣·弗兰西斯·波吉亚（Francis Borgia，1510–1572），其卓著功绩被誉为继耶稣会会祖罗耀拉·圣依纳爵（Saint Ignatius of Loyola）之后的最伟大的会长，1671年被列入圣品，10月10日被定为他的纪念节日。