九三学社是以科学技术界高、中级知识分子为主的具有政治联盟特点的政党，是接受中国共产党领导、同中国共产党通力合作的亲密友党，是进步性与广泛性相统一、致力于中国特色社会主义事业的参政党。
海南的九三学社组织萌芽于儋州，岛内早期的九三学社社员均为在外地入社后迁入海南的，最早的一批社员可以追溯到1958年，华南亚热带作物研究所（即中国热带农业科学院的前身）迁至海南儋县（即现在的儋州），该所的九三学社社员成为了第一批在海南长期工作的社员。1966年“文化大革命”开始后，九三学社的各级组织与其他民主党派一样被停止活动。早期海南九三学社社员除了在热作所和南洋水产公司，主要集中在海南大学、海南师院、海南医学院等高等院校和科研单位。1981年，九三学社广州分社委员会指定海南师范高等专科学校讲师蒙锐诚为九三学社海南行政区的联系人。1988年海南建省办经济特区，同年11月，经九三学社中央执行局批准，九三学社海南省委员会筹备组在海口正式成立。1989年10月27日至29日，九三学社海南省第一次代表大会在海口市举行，出席大会的代表53人。
截至2015年12月，社员从成立时的147人发展到1079人，其中，科学技术界188人，占比17.4%；医药卫生界248人，占比23%;高等教育界257人，占比23.8%；成员平均年龄45岁；高级职称457人，占比42.4%。目前，本省现有地方组织3个，其中省级委员会1个，市级委员会2个（海口、三亚）。九三学社海南省级委员会下辖2个省直属委员会、22个省直属支社，1个筹备市委会（儋州），4个支社筹备组。海口市委员会下辖4个基层委员会（海口市龙华区基层委员会、海口市美兰区基层委员会、海口市秀英区基层委员会、海口市琼山区基层委员会），三亚市委员会下辖4个支社。社省委下设八个专门工作委员会：参政议政、环境资源、旅游与现代服务业、对外联络与妇女、教科文卫、经济社会、思想建设研究中心和法律。社省委机关设有一室二处，即办公室、组织处、宣传调研处三个部门。