仁德区分为十八个里，分别为仁爱里、
仁和里、
成功里、大甲里、二行里、中生里、中洲里、新田里、后壁里、保安里、田厝里、太子里、
仁德里、仁义里、土库里、上仑里、一甲里、三甲里。
仁德旧名“土库”，在
荷兰人抵达以前，此处很可能是平埔人西拉雅人的活动范围。
明郑时期称此地为仁德里。
1920年，
日本于此地设仁德庄，属
台南州新丰郡管辖。
1940年，仁德庄所属虎尾寮
大字并入
台南市，同时废庄之永宁庄部分大字改隶仁德庄。
战后改为仁德乡，由
台南县管辖。1970年代
中山高速公路完工后，设台南交流道于仁德乡境，交通地位大增、发展迅速。今日仁德以工商业著名，境内有保安、新田、一甲三个工业区。仁德别称“企业之乡”—例如跨国企业奇美实业、灿坤实业皆发迹于仁德。
2010年12月25日改称仁德区。