按最新的在 New England Journal of Medicine上发表的数据显示，中国有超过9,200万的糖尿病患者，约1.4亿的糖尿病前期患者，数量均占据着世界第一的位置。
代谢综合征是指在同一个病人个体，有
向心性肥胖、
胰岛素抵抗、糖耐量受损或2型糖尿病、高血压病、高血脂症（低HDL，高LDL，高胆固醇，和高甘油三脂） 、
微量白蛋白尿、高尿酸和非酒精性脂肪肝等多项并发症。就适合中国人群的定义来看，城市20岁以上人群中代谢综合征的患病率已达14%~16%，且这些患者中癌症的发病率也在显著地升高。中国的
慢性肾病患者已超过一个亿，老年痴呆症的患者也达到了7百多万。这些重大代谢疾病的治疗周期长，费用昂贵，对社会和个人的财富有着“黑洞”般地吞噬效应。而与这一严峻形式相对应的是，在中国，治疗这些疾病基本依赖进口药物；国内的院校和药厂还缺乏相应的系统化的研发基地。
2009年，
南京医科大学陈琪校长和陈国钧书记领导的校领导班子基于新世纪科学发展观，建设高水平科研人才队伍的战略需求，及引进海外创新人才的方针，与来访的
美国匹兹堡大学研究代谢疾病的六人教授团队进行了多次探讨。团队成员提出利用南医正在快速发展的优势，以正在筹建的现代化动物模型中心为基地，建设一个系统化的具有世界领先水平的代谢疾病研究平台。在经历多次探讨和专家的严谨论证后，建设中国第一个代谢疾病研究中心的概念产生了。南京医科大学校领导也决定为中心的启动和运行、各式仪器设备的配置，进行强有力的支持。2009年12月12号，代谢疾病研究团队的成员正式加盟陈琪校长领导的南京医科大学，中心正式开始运作。