储藏在种子或其他储藏器官中的有机物质的种类很多，但其中最主要的有三类：即碳水化合物脂肪和蛋白质。它们在植物体中的含量最多，并且经常进行着转化。

种类

淀粉

淀粉(starch)是葡萄糖分子聚合而成的长链化合物，它是细胞中碳水化合物最普遍的储藏形式，在细胞中以颗粒状态存在，称为淀粉粒(starch grain)。所有的薄壁细胞中都有淀粉粒的存在，尤其在各类储藏器官中更为集中。淀粉遇碘呈蓝紫色，可作为鉴别其存在的依据。

淀粉粒可以在白色体内形成，也可以在叶绿体内形成。光合作用过程中产生的葡萄糖，在叶绿体中聚合成淀粉，暂时储藏，这种淀粉粒称初生淀粉粒( primary starch grain)。初生淀粉粒是暂时的，不久就被分解成葡萄糖，转运到储藏细胞的白色体内，糖在白色体内又重新形成淀粉粒，称次生淀粉粒(secondary starch grain)。这种储藏淀粉的白色体称为造粉体(淀粉体，amyloplast)。

蛋白质

细胞中的储藏蛋白质呈晶体或无定形固体状态，生理活性稳定。结晶的蛋白质因具有晶体和胶体的二重性，因此称拟晶体(erystalloid), 以与真正的晶体相区别。蛋白质拟晶体有不同的形状，但常呈方形，例如，在马铃薯块茎上近外围的薄壁细胞中，就有这种方形结晶的存在。无定形的蛋白质常被一层膜包裏成圆球状的颗粒，称为糊粉粒(a-leurone grain)，广泛存在于细胞的任何部分，如液泡、细胞质、细胞核、质体。储藏的蛋白质遇碘呈黄色。

脂肪和油

脂肪和油是含能量最高而体积最小的储藏物质，在常温下为固体的称为脂肪，液体的则称为油。脂肪和油的区别主要是物理性质的，而不是化学性质的，它们常成为种子、胚和分生组织细胞中的储藏物质，以固体或油滴的形式存在于细胞质中，有时在叶绿体内也可看到。脂肪和油在细胞中的形成可以有多种途径，例如，质体和圆球体都能积聚脂类物质，发育成油滴。脂肪和油遇苏丹I或苏丹N呈橙红色。