兖州府，明清时期山东地区设置的府一级行政区，治滋阳县。明洪武十八年，升兖州为兖州府。清沿之。民国废。

明洪武十八年（公元1385年），升兖州为兖州府。 故治在滋阳县（今济宁市兖州区）。领济宁、东平、曹、沂四州二十三县。其中嵫阳（滋阳）、曲阜、宁阳、邹、滕、峄、泗水、金乡、鱼台、单、城武等11县为兖州府直领，另12县为济宁州、曹州、东平州及沂州所辖。济宁州，明初为济宁府，洪武十八年降为兖州府所辖散州，领本辖（原府治任城县）及嘉祥、巨野、郓城三县。曹州，元为直隶州，明初省州治济阴县，后迁州治于今曹县，又降州为曹县，成化年间复设曹州，领本辖及曹、定陶两县。东平州，元为东平路，明初为东平府，洪武七年降为济宁府所辖散州，后属兖州府，领本辖（原府治须城县）及阳谷、东阿、平阴、寿张、汶上等五县。沂州，元为益都路所辖散州，明初省州治临沂县并改设济宁府，后先后为济南府、青州府所辖，兖州府成立后属之，到明末领本辖及郯城、费两县。

清因明制，仍称兖州府，属兖沂曹济道，并为道治所，仍领四州二十三县。雍正年间（公元1723—1735年），沂、曹、济宁、东平四州直隶于省，先后割县十三，不再领州，只领滋阳、曲阜、邹、泗水、滕、峄、汶上、阳谷、寿张十县。金乡、鱼台、嘉祥归济宁州；东阿、平阴、东平州归泰安府；曹州、单县、成武、曹县、定陶、巨野、郓城建立曹州府；沂州、郯城、费县建立沂州府。

民国初，废兖州府。

明万历《兖州府志》：于慎行 明万历二十四年刻本

清乾隆《兖州府志》： 陈顾 清乾隆三十五年刻本

《兖州府志》是于慎行在万历十八年（1590）至三十五年（1607）致仕家居期间，应兖州先后两位知府易澄瀛和卢学礼的邀请，而用了三年的时间完成的一部府志。该志书最早的刻本是万历二十四年（1596）本，但目前国内已绝少流传，20世纪60年代曾在钜野发现该志书，被认为是孤本，但缺少“人物志”和“典籍志”。80年代，经山东大学著名学者殷孟伦教授拜托日本学者波多野太郎教授从日本宫内省图书寮复制所缺的二志，并由齐鲁书社于1990年出版，终使这部散佚多年的明代方志杰作重新问世，给后人研究于慎行提供了重要素材。

明代的兖州府，包括今天的济宁、菏泽、泰安、枣庄、临沂等市的三十余县，是当时管辖县较多的一个府。在嘉靖年间，曾有《兖州府志》，在其后的清代康熙年间，也有《兖州府志》，综观几部不同时期的《兖州府志》，可以看出，于慎行所修的《兖州府志》与其他二志相比较，无论是从体例之严谨、选材之丰富，还是考证之精确等方面都要胜出一筹，尤其是该志的史料价值更为后世研究者所公认，称此为研究古代山东地方史，尤其是兖州地方史必不可少的重要文献。