厦门集美灌口凤山书院始建于清乾隆十一年（公元1746年），由时任
同安知县张荃倡于安仁里凤山之上兴建凤山书院。。
厦门集美凤山书院自创建以来，教泽宏敷，生徙云聚，钟灵毓秀，英才辈出：闽南小刀会首领黄位与黄志信、侨领张永福、海洋生物学家
曾呈奎，尝就学于此；仁人志士陈瓞臣、庄尊贤、陈少瀛、陈延香、庄右南、肖甸帮诸公，亦于此执教也。
清乾隆十一年（公元1746年），
同安知县张荃倡于安仁里凤山之上兴建凤山书院。有贡生王三锡、举人陈连榜者，集资募款，数月而竣役也。乾隆廿四年（公元1759年），里人叶仰高募众重修之。越四年，陈方旋倡建文昌祠于凤山祖庙之右庑。书院二进，前为会文之所，后祀朱子及文昌诸神，右复筑书舍有三，凡登第及入泮者例得题名也。同安儒学教谕何兰与训导黎学安曾临视导，且为之作序焉。宣统二年（公元1910年），堂长陈师勋奉命改书院为灌口凤山两等小学堂，时乃同安县最早学堂之一也。民国六年（公元1917年），由陈宗河发起，旅缅华侨黄文荣、张永福竭力捐助，以草仔市陈氏祠堂为校舍，改凤山学堂为
同安县第八区第一高小国民学校。公元1919年，始列入公立，命名为厦门集美灌口小学。
辛亥革命伊始，书院即为灌口同盟会之据点，陈瓞臣、庄尊贤率民军，举义旗，反袁护国，兵下同安，席卷漳泉，其煌煌业绩，永垂汗青。上世纪50年代末，文昌祠占用为粮仓。直至公元2006年，因扩建
凤山祖庙而拆毁之。昔日书院，已荡然。悲哉惜哉！
而今改革开放，国运昌盛，市井繁荣，物阜民殷，百废俱兴。公元2013年，为传承文化、丰富人文、尊师重教、以励后人，集美区政府假风景湖公园建设之机，以闽南红砖古厝之独特风格，于此重建凤山书院，并于堂前竖立孔子塑像，以供四方学子敬拜。新院坐北朝南，暖风朱雀；天罩祥云，地载神气；背靠仙灵棋山，面向马銮海湾；两侧亭台栈道，长桥卧波，山色空蒙，瑶水碧绿，竹柳扶风，虫鸟争鸣。有流泉之悦耳，无闹市之嘈杂。掩长卷兮，倚门窗，静听芭蕉落雨；吟诗书兮，诵经文，细品历代精华。书院之重建，断非重蹈古制、复施旧学，而在于继承国粹、重拾精神、澊化世风、修养心性、探究社会谐和之道理，追求普世公认之价值；培养浩然中正之气，编织幸福美好之梦。自此，书香流韵于风景湖畔，国学弘扬及八方乡邻。斯文在玆，功德无量。