北京三元基因工程有限公司，是一家现代医药生物技术企业，主要从事研制、开发、生产和销售医药生物技术产品，包括
基因工程药物、
基因工程疫苗和
诊断试剂，并从事与之相关的技术贸易与技术服务业务。
三元基因于1999年5月通过国家GMP企业认证。其主要产品“
运德素”是国家一类新药，用于治疗多种病毒性疾病和恶性肿瘤。“运德素”是
侯云德院士从健康中国人基因中成功克隆与表达出来的重组人α1b干扰素。
运德素适用于治疗
病毒性疾病和某些
恶性肿瘤,已批准用于治疗
慢性乙型肝炎,
丙型肝炎和
毛细胞白血病,已有临床试验结果或文献报告用于治疗病毒性疾病如带状疱疹,
尖锐湿疣,流行性出血热和
小儿呼吸道合胞病毒肺炎等有效,可用于治疗恶性肿瘤如
慢性粒细胞白血病,
黑色素瘤,淋巴瘤等,还适用于治疗病毒性疾病和某些恶性肿瘤,已批准用于治疗慢性乙型肝炎,丙型肝炎和毛细胞白血病,已有临床试验结果或文献报告用于治疗病毒性疾病如带状疱疹,尖锐湿疣,流行性出血热和小儿呼吸道合胞病毒肺炎等有效,可用于治疗恶性肿瘤如慢性粒细胞白血病,黑色素瘤,淋巴瘤等.
三元基因2001年被国家人事部正式批准设立
博士后科研工作站。该工作站拥有一支具有现代医学、药学与生物技术等学科背景的高素质专业研发队伍，GLP标准实验室设备齐全，具有先进的程控发酵系统、蛋白纯化系统及相关的基因工程研究试验仪器，可完成从分子生物学、蛋白质提纯、
细胞培养、
质量控制、药理毒理、
制剂学研究、直至临床研究等系统的生物技术产品研发工作。同时，利用丰富的网络信息资源，研发中心具有全面跟踪国内外新药研究动向的快速反应能力。整体研发实力在国内处于领先地位。
工作站联合国内一流科研机构如复旦大学、北京大学、清华大学、
中国协和医科大学、
军事医学科学院等共同培养博士后。
基因工程蛋白类药物：治疗病毒性疾病、肿瘤、心血管病以及免疫病等各类药物； 蛋白质药物特殊制剂：长效制剂、
缓释制剂、粉雾剂、透皮吸收剂、口服制剂等； 治疗性抗体：治疗肿瘤、自身免疫性疾病等的
人源化抗体。 基因诊断和基因治疗：基因诊断平台技术及试剂盒，有应用前景的基因治疗方法； RNAi: 针对病毒性疾病、肿瘤等的新设计和制剂研究； 干细胞和组织工程：干细胞和组织工程的基础与应用；
疫苗：创新性和替代性疫苗和制剂； 临床前药物评价：开发新的评价方法。
三元基因的目标是通过不懈努力使公司成为三理想企业， 即：对顾客，三元基因是优质、高效药品的理想生产与服务企业；对员工， 三元基因是学习创新，实现自我价值的理想工作与学习企业；对股东，三元基因是高成长、高收益的理想投资企业。
三元基因实行董事会领导下的总经理负责制，原任董事长由中国工程院院士侯云德先生担任，现任董事长由印小明先生担任。总经理程永庆先生是中国最早从事高技术创业与风险投资的职业经理人之一。