北京中医药大学东直门医院位于北京市东城区海运仓5号，始建于1958年，是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等中医医院，是北京市医保定点单位。

1958年医院在北京市东城区正式成立。

1997年医院成为北京中医药大学“第一临床医学院”。

2011年原通州区中医医院与医院整合，并正式命名为北京中医药大学东直门医院东区。

医院设有心血管内科、呼吸科、肾病内分泌科、消化科、脑病科、血液肿瘤科、妇科、儿科、产科等科室。其中，国家临床重点专科6个，国家中医药管理局重点专科16个，北京市重点专科（北京市特色诊疗中心）11个，教育部重点学科1个，国家中医药管理局重点学科9个，北京市重点学科2个。另外，医院还设有全国名老中医药专家传承工作室16个，北京中医药“薪火传承3+3”工程“二室一站”14个，教育部创新团队1个。

医院配有BVI眼科超声诊断仪、Humphrey®-Field-AnalyzerHFA-II-i视野计、半导体眼底激光、玻璃体切割机、彩色荧光眼底造影机、超声乳化仪、超声雾化中药熏治机、串状三棱镜、电脑验光仪、非接触眼压计、角膜曲率仪、快速消毒仪、瑞士900裂隙灯、手术显微镜、双目间接检眼镜、同视机等医疗设备。

2020年9月，被中共北京市委、北京市人民政府评为：北京市抗击新冠肺炎疫情先进集体。

北京市东城区海运仓5号。