2019年9月23日，北京市地铁运营有限公司被中华人民共和国教育部、中华人民共和国国家发展和改革委员会、中华人民共和国工业和信息化部、国务院国有资产监督管理委员会评为首批
全国职业教育教师企业实践基地。
2020年12月25日，北京市地铁运营有限公司被中华人民共和国国家卫生健康委员会、
中国红十字会、
中央军委后勤保障部卫生局授予
无偿献血促进奖特别奖。
北京市地铁运营有限公司负责
运营管理的线路共有16条，包括
北京地铁1号线、2号线、3号线、5号线、6号线、7号线、8号线、9号线、10号线、11号线、12号线、13号线、15号线、亦庄线、房山线、昌平线、S1线，运营总里程538千米，运营车站330座。
北京市地铁运营有限公司
主营业务涵盖轨道交通运营服务和轨道交通
增值服务。轨道交通运营服务包含轨道交通客运、设备设施维修、轨道交通
车辆修理、
技术研发等；轨道交通增值服务包含
地铁广告传媒、民用通信、
地铁商业、
文化创意等。
北京市地铁运营有限公司的标识从内向外由“B、D、G”三个字母组成，“B、D、G”为“
北京地铁公司”的缩写，“B”是“北京”中“北”字的汉语拼音首字母；“D”是“地铁”中“地”字的汉语拼音首字母；“G”是“公司”中“公”字的汉语拼音首字母，也是“
轨道交通”中“轨”字的汉语拼音首字母，有轨道交通的含义。北京市地铁运营有限公司的标识色为蓝色。此标识也是北京地铁行业的向导标识。
2023年12月14日晚18:57，北京地铁昌平线西二旗站-生命科学园站上行区段一列车车厢脱离，迫停区间。已发现30余人受伤，无人员死亡，伤员正陆续送往医院治疗，现场正在积极处置。事故原因正在调查中。
2023年12月14日23:00，北京地铁公司官方微博发布消息称对当晚昌平线事故深表歉意。地铁公司方面表示，将尽全力做好善后工作。在救援疏散过程中已自行离开的乘客，如后续感到身体不适，可随时联系地铁公司，地铁公司将承担相应治疗恢复费用。
2024年7月30日，有网友发图称，北京地铁回龙观站被淹。对此，北京地铁公司发现场图辟谣。北京地铁公司表示，截至目前，地铁公司所辖各线运营平稳，请乘客及时关注官方发布的运营动态。