北京脑科学与类脑研究所（Beijing Institute for Brain Research），成立于2018年3月22日，是北京市政府与
中国科学院、
北京大学、
清华大学、
北京师范大学、
中国医学科学院、
中国中医科学院等单位共建的新型研发机构。
2018年3月22日，北京脑科学与类脑研究所在北京成立，标志着北京脑科学与类脑研究所建设工作全面启动，这既是落实关于设立国家科技创新-2030重大项目的战略部署，也是北京加强科技创新中心建设的又一项重要举措。
北京脑科学与类脑研究所将集结全校力量，对脑科学相关领域如
人工智能、脑机交互作用、
生物医学工程、磁共振脑成像、光学成像、神经生物学、
基础医学、
临床医学等进行研究。如果该计划实现，北京大学将从学科综合、科研质量和组织模式三方面，建立起中国首屈一指的脑科学研究团队。
2024年6月，北京协和医学院脑和类脑学院和北京脑科学与类脑研究所（以下简称“北京脑所”）实行一体化管理，以构建国家脑科学科技创新体系核心基地和建设世界一流脑科学新型研发机构为目标，招收培养的博士研究生符合北京协和医学院毕业和学位授予条件的，由北京协和医学院颁发学历、学位证书。
研究所重点聚焦脑认知原理解析、脑重大疾病、神经科学新技术、
神经计算与神经编解码研究等四大研究方向。
北京脑科学与类脑研究所作为新型研发机构，将以一种更加创新的机制凝聚全球的创新资源，以跨学科交叉的形态创造出更多重大成果，形成服务于经济社会发展和人民健康需求的重要战略科技力量。北京脑科学与类脑研究所未来将瞄准世界脑科学与类脑研究前沿和国家在脑科学与类脑研究领域的战略急需，通过建立协同创新、科学高效的运行机制，汇聚全球顶尖科学家及其创新团队，整合脑科学与类脑研究领域优势资源，搭建脑科学与类脑研究综合性实验和研发平台。
北京脑科学与类脑研究所将围绕首都“全国科技创新中心”的战略定位，以及国家脑科学计划“一体两翼三大需求”的重点研究方向，结合北京的工作基础和优势特色，通过机制体制创新，汇聚和培养一批国际顶尖专家团队，服务国家战略需求，推进脑科学领域高水平研究创新，产出一批“领跑型”原始创新成果，实现基础研究、应用研究、成果转化、产业化等环节的有机链接，将北京中心建成世界一流的脑科学研究机构，发挥北京脑科学与类脑研究所在国家脑科学计划中的引领作用，将北京建成具有全球影响力的脑科学研究所。
北京脑科学与类脑研究所成立于2018年3月22日，作为北京市重点推进建设的新型研发机构之一，由北京市政府与中国科学院、北京大学、清华大学、
北京师范大学、
中国医学科学院、中国中医科学院等单位联合共建，实行理事会领导下的主任负责制，设理事会、评估委员会、审计委员会和中心主任，下设专家委员会、多个独立实验室及辅助中心、科研事务部、研究生管理部及行政服务部门，组织架构如图1所示：
北京市政府和中国科学院、军事科学院、北京大学、清华大学、北京师范大学、中国医学科学院、
中国中医科学院8家单位共同签署了《北京脑科学与类脑研究中心建设合作框架协议》，八方本着“战略引领、优势互补、资源共享”的原则，从建立存量资源整合与新增资源共享机制、人才互补与双聘双赢机制、科研成果与知识产权共享机制、联合招生与人才培养机制、共同争取国家重大项目落地等方面开展合作，推动北京中心建设，为国家创新战略做出贡献。