半索动物亚门（Hemichordata）是半索动物门的一个亚门。半索动物又称隐索动物（Adelochordata），是一些口腔背面有一条短盲管（口盲囊，俗称口索）前伸至吻内的海栖动物类群。1825年黄殖翼柱头虫最早被发现，现已有90多种，包括身体呈蠕虫状的肠鳃纲和形似苔藓动物的羽鳃纲两大类。

在浅海和潮间带，营单体自由生活或集群固着生活。身体蠕虫状，多穴居在泥沙中，体长2-250 cm。典型的代表是柱头虫。

1、有鳃裂：咽区背侧排列着许多（7-700）成对的外鳃裂。

2、口索：口腔背壁向前突出一个短盲管至吻腔基部，盲管的腹侧有胶质吻骨，称口索。

3、背神经索，前端呈管状。背、腹神经索在领部相联成环。

4、身体分三部：吻、领、躯干。

1、身体长蠕虫形，分吻、领、躯干三部分。吻在最前端，具体腔，吸水可膨胀；

2、躯干部分为鳃裂区、生殖区、肝囊区和肠区，末端为肛门。

1、体腔包括一个吻体腔、成对的领体腔和成对的躯干体腔，3个部分间有隔膜。

2、躯干部前端两侧有鳃裂孔，咽壁有鳃裂。

3、躯干部细长，前部两侧向外延伸形成翼状板，内有生殖腺，称为生殖翼。

4、肛门在躯干部未端。

5、雌雄异体，体外受精。

生殖腺的外形相似，呈小囊状，成对地排列于躯干前半部至肝囊区之间的背侧。性成熟时卵巢呈灰褐色，精巢呈黄色。受精卵经过辐射卵裂，以内陷法形成原肠胚，再经肠腔法形成中胚层和体腔，也有前、中、后三分体腔。幼虫与海参的短腕幼虫相似，称为柱头幼虫，游泳数日或数周后沉人水底变态为成虫。有的种类以长有纤毛的原肠胚形式自由生活，然后直接发育为成体。发育过程类似于棘皮动物。

6、具原始的开管式循环系统。

主要由纵走于背、腹隔膜间的背血管、腹血管和血窦组成。背血管在吻腔基部略为膨大呈静脉窦，再往前则进入中央窦。中央窦内的血液通过附近的心囊搏动，注入其前方的血管球，由此过滤排出代谢废物至吻腔，在从吻孔流出体外。从血管球发出4条血管，2条分布到吻部，2条汇合成腹血管。