单倍群D属于人类Y染色体DNA单倍型类群之一，由突变M174定义，分布于东亚。

单倍群D的先祖与单倍群C（Y-DNA）一起，构成离开非洲的第一批主要的移民潮，复旦大学的分子人类学教授李辉将单倍群d与单倍群c认为是最早来到远东的两个人种（俗称矮黑人种）在日本列岛和中国西部及青藏高原各个民族中都有高频的分布。由于在印度洋安达曼群岛的小安达曼的两个尼格利陀部落中最先发现d型单倍群，也因为早期测试资料不足，因此以安达曼尼格利陀人为体质原型为其代称Y染色体中的矮黑人基因，但更多资料显示现仅存的尼格利陀矮黑人体质的族群单倍群并非只有D更多的为K.C.P.O，如菲律宾埃塔人，马来西亚塞芒人，而Y染D更多分布于传统体质划分蒙古人种体质特征中藏族，羌族，彝族与现代日本人中

D-M174：较早期到达东亚的人群，其分支为印度洋安达曼小安达曼群岛两个部落族，昂格人，加洛佤人都达到100%，中国四川平武县及甘肃文县白马藏族中也都达到100%，而其它的中国西部民族普米族70%拉萨藏族58%康巴藏族75%纳西族35%羌族50%彝族16%，在日本列岛中，大和民族35%阿依努88%日本琉球55%，在中国华南华中的壮侗苗瑶等群体也有近10%左右。

D-m174型单倍群的分支在中国的分布情况:

甘肃文县白马藏族100%，四川平武县白马藏族100%，西藏藏族50.89~70.2%，普米族70.23%，四川羌族50.63%，纳西族18.3%，回族11.4%，瑶族11.27%，彝族16.3%，苗族8.6%，土家族2%，汉民族1.9%~2.1%，满族2.9%，锡伯族2.4%，维吾尔族2.6%~4.5%，

走出非洲的Y染色体M168父亲后代中发生的第一个突变，就是在Y-DNA中插入一个Alu element，也叫YAP（ Y-chromosome Alu Polymorphism）。这个突变只见于DE*、D与E单倍群人，剩下的人的等位基因没有这个突变。

DE突变，很可能是有害多于有益，因此很快他的后代又发生了两次突变，一个是D-M174，一个是E-M96，也就是D单倍型与E单倍型。没有新的突变发生的（或者目前没检测到）DE被标记为DE*，他们今天极为少见，西藏、尼日利亚曾经发现几例。

DE这个YAP突变发生在哪里？他们都带有M168突变，说明应该是非洲以外，大家一致认为是亚洲，因为早期从海湾的迁徙是向东的。奇怪的是，作为人类迁徙重要通道的印度，没有发现YAP人群，南北都没有。

曾经认为，他们应该发生在南亚，因为安达曼人几乎100%是D单倍群，时间大约是70000年前。现在一些重要的研究者认为，应该是发生在中亚、西伯利亚或青藏高原，时间在76000年前，因为藏人的多样性最高。

D单倍群是走出非洲的男性祖先—发生了Y染色体M168突变的群体中，首先产生新的突变的后代，E单倍群是其同辈（主要在西亚、北非与欧洲）。

今天D单倍群以群体规模仅存在三个地方：安达曼群岛，西藏，日本阿伊努，蒙古高原与哈萨克斯坦有另一个类型。藏人单倍群dM174之后有新的突变，主要是D-M15。日本绳文人，无论是北海道还是琉球，都是D-M55。

最新研究表明（不同的研究），他们53000年前就与最古老的D单倍群安达曼人的D*分离，跟藏人和大洋洲人不一样他们没有丹尼索瓦人基因，他们在几万年内也很少发生基因交流。更独特的是，绳文人Y-DNA具有5个独特的突变。这些事实提示，他们在5万多年前就游离于（孤立于）欧亚大陆之外。

那么他们是从哪里去日本的？这是我想知道的。图片别当真，仅仅是过去的一些假说。

Y染色体D单倍群分布

D-M174单倍群下面主要有几个分支：

1，D-M15（D1a1a）

说藏缅语的，羌人23%，藏人 12.5%。彝族9%，广西瑶族19.4%，柬埔寨老族5.6%，日本人4.3%。

2，D-P47（D1a1b1）

藏人45.3%，西安汉人9%，普米族70%、纳西族、及中亚一些族群也有一定比例。

3，D-M55（D1a2）

这是一个非常独特的亚型，至少有5个特异性的突变，占阿伊努人的绝大多数，可以说是虾夷人独特的Y染色体单倍群标记。阿伊努88%，大和人32%.琉球人55%韩国3-4%

根据Boeretal.（2020）的全基因组研究，分析了几个绳文标本，发现它们在遗传上与现代的亚洲人不同，通过西伯利亚移动到日本的可能性很高。结果是不支持假设的南方路线。

4，D*（D1a3）

安达曼群岛尼格利陀人

5，在阿尔泰发现一些古老类型，D*约有5-6%，尤其是Kosh-Agach14%、Kulada10.9%。哈萨克人约0.5-1.9%，北高加索Kara-Nogais人5%，Kuban Nogai 1.1%，khalkha蒙古人2.7-4.2%，Zakhchin蒙古3.3%，乌梁海1.7%，Kalmyks1.2%。近年的一些商业测试，在突厥语、蒙古语族人中都有发现，甚至罗马尼亚与伊拉克也有。

安达曼人中的昂格人和加洛佤人单倍群D高达100%,他们身材矮小男性身高在130cm~140cm且皮肤深黑，眉弓较为突出，在传统体质人类学分类上属尼格利陀人种，也就是俗称的“矮黑人”。

由于安达曼尼格利陀体质的存在所以在民间Y染色体基因D也有尼格利陀矮黑人基因的俗称

然而实际上拥有较多单倍群d的现代藏族与现代日本人在体质上都属于黄种人东亚类型。