社科院下设三个研究所：经济发展研究所、
社会发展研究所、文化与历史研究所，南京市民意调查中心日常办公机构也在社科院，社科院还与有关单位联合成立有中国（南京）城市发展战略研究院、河西新城发展研究院、国际和平研究所、非物质遗产研究所、教育科学研究所、人口发展研究中心等研究机构。
市社科院主要从事当代马克思主义理论及经济社会文化发展中的重大课题研究，组织各种学术活动与开展对外学术交流，向市委、市政府报送研究成果和对策性建议。长期以来，市社科院以
邓小平理论和“三个代表”重要思想和科学发展观为指导，紧密围绕市委、市政府的中心工作，较好地发挥了学术团体和研究机构知识密集、联系广泛和研究人员专兼结合的优势，认真履行
哲学社会科学认识世界、传承文明、创新理论、咨政育人、服务社会的职责。
社科院成立以来，坚持开门办院，以科研立院、人才兴院、管理强院为抓手，立足南京、服务江苏、围绕中心、面向实际，努力催生了500多项社科研究成果，为党和政府决策提供了富有成效的理论支持和咨询服务，积极发挥了城市社科院社会科学新智库的功能，多次被评为“全国优秀城市社科院”。
简介： 饶 红：女，1966年9月出生，中共党员，
硕士研究生，副教授职称。
简介： 付启元，男，1975年5月生，中共党员，研究生学历，副研究员职称，
南京市行政区划地名学会会员。