南开大学日本研究院是对日本历史、政治、经济、思想、文化、社会、语言、文学等进行综合性研究的实体学术机构。其宗旨是采用专职和兼职相结合的形式，集中该校较有成就的日本研究人员和国内外知名学者，通过合作研究及独立研究、学术研讨会、日本学讲座、日语培训等形式，广泛开展各种学术交流活动，同时培养从事日本研究的硕、博士研究生，旨在使本研究院成为中国日本学研究的重镇和培养日本研究高级人才的基地。

2012年11月 宋志勇教授担任南开大学日本研究院院长

2007年3月 李卓教授担任南开大学日本研究院院长2007年3月 杨栋梁院长卸任，转任南开大学世界近现代史研究中心主任

2003年4月 南开大学日本研究院正式宣告成立。

2000年3月 日本研究中心成为系所级实体单位，行政挂靠文学院。主任为中心负责人，理事会为中心咨询机构。

1999年5月 日本研究中心第五届理事会成立

1996年7月 日本研究中心第四届理事会成立

1994年6月 日本研究中心研究楼落成典礼

1993年6月 日本研究中心第二届理事会成立

1988年5月 召开日本研究中心成立大会

1988年4月 俞辛淳教授等发起筹建日本研究中心，第一届中心理事会成立。

1985年 历史系招收首批日本研究方向博士研究生

1980年 历史系、经济系招收首批日本研究方向硕士研究生

1975年 经济研究所日本经济研究室成立

1972年 外文系日本语言文学教研室成立

1964年 历史系日本史研究室成立

南开大学日本研究院下设日本历史与文化、日本经济、日本政治与对外关系三个研究部，分属于世界史、世界经济、国际政治等国家重点学科，分别授予历史学、经济学和法学学位。日本研究院现有教授5人，均为博导，副教授6人。

世界史——日本经济史、日本外交史（中日关系史）、日本社会史、日本文化史、日本政治史、日本古代史、日本近现代史、日本战后史（博士学位授予权）；日本思想史、日本教育史等（硕士学位授予权）。

世界经济——日本经济、日本企业、日本金融（博士和硕士学位授予权）

国际政治——日本政治、日本外交、中日关系、东亚国际关系（硕士学位授予权）。