全称厦门五通海空联运码头，简称五通客运码头，位于
厦门岛东北角
五缘湾五通港区，厦门北侧水道南岸，距离
厦门站11公里，
厦门高崎国际机场7公里，金门水头码头8海里，并位于五缘湾商务运营中心和
观音山国际商务营运中心之间，乘
高速双体船到金门只需15分钟，交通便捷，是往来厦门、金门优良的通道。五通客运码头于2001年试运营，2008年8月31日正式通航，旨在服务厦门与 大小
金门岛之间的旅客运输，以及往返大陆与台湾之间旅客的海空联运，并促进推进未来厦门、台湾两地“无缝隙通关”，随着政策的放开，经由厦金航线往来的台胞、旅客将持续稳定增加，厦金
小三通已经成为两岸往来最重要和最方便快捷的通道。
五通客运码头候船楼项目占地19800平方米，建筑面积18000平方米。建有两层候船楼一栋，候船楼采用全钢玻璃结构，建有中央空调和新风系统，内部设计24小时安防监控，双回路电源，网络和通讯畅通。由于本码头比邻五缘湾区域，随着仙岳大道和集美大桥的通车和周边配套的形成，以及翔安海底隧道的建成使用，五通码头区域的交通便捷通达优势将更为明显突出。
厦门五通至金门水头航道，被称为厦金航线“第二航道”，设计水深4米，航道宽200米。本航道具有航程短、速度快的优势。因本码头距离厦门机场只有7公里，下船后需转乘飞机的台胞可在本码头直接办理厦门机场值机手续，即只需订一张海空联运套票，就能够享受从轮船到飞机的“一条龙服务”，不仅缩短了旅程，而且免去了转乘飞机的繁琐手续，台胞将得到方便快捷的中转服务。
2019年6月3日上午8时许，“新五缘”号客轮载着165名旅客从厦门五通码头驶出前往金门。这标志着厦金航线厦门五通客运码头三期全面启用。以后，所有从厦门出发的厦金航线旅客，均转由三期候船楼登船。