厦门市足球协会成立于1996年8月，是厦门市体育局授权组织和指导开展厦门市足球运动的群众性组织和管理机构，是经厦门市民政局批准登记的是厦门市足球运动领域的社团法人，是由厦门市范围内的足球组织和个人自愿结成的全市性足球专业的社会组织，是唯一代表厦门的中国足球协会会员，也是唯一代表厦门的福建省足球协会会员，也是厦门市体育总会的会员。

厦门市足球协会由会员代表大会、理事会、监事会组成。第四届会员代表大会于2018年9月27日召开，产生了第四届理事会和监事会。

厦门市足球协会下设8个专业委员会：竞赛委员会、技术委员会、纪律委员会、仲裁委员会、裁判委员会、青少年委员会、运动员委员会、道德与公平竞赛委员会。

厦门市足球协会常设3个工作机构：竞赛部、技术部、办公室。

主席：徐模

法定代表人：陈国强（兼）

副主席：陈金火、王国珍、吕锜、陈国强、郑朝南、曾仁荣、刘将峰

监事长：王介福

监事：陈伟东、林亚荣、张建山、陈则勇