中心主要承担国家减灾救灾数据信息管理、灾害及风险评估、产品服务、空间科技应用、科学技术与政策法规研究、技术装备和救灾物资研发、宣传教育培训和国际合作交流等职能,为政府减灾救灾工作提供信息服务、技术支持和决策咨询。
中心属财政全额拨款事业单位,内设办公室(党委办公室)、运行管理中心、数据中心、评估与应急部、卫星遥感部、航空遥感部、科技标准部、技术装备部、政策研究部、减灾和应急工程重点实验室、灾害评估与风险防范重点实验室、国际合作部、财务部、宣传教育中心和后勤保障部等15个职能部门。同时,中心还与国际、国内有关机构、部门联合成立了“国际减轻旱灾风险中心”、“
中国空间技术减灾应用研究中心”等机构。