国家棉花产业联盟由
中国农业科学院棉花研究所联合棉花生产、加工、流通、纺织服装等市场主体发起成立。2016年11月28日国家棉花产业联盟成立大会在北京召开。
国家棉花产业联盟是在农业部倡导成立的“国家农业科技创新联盟”框架下组建的专业联盟，是“国家农业科技创新联盟”的重要组成部分，是由中国农业科学院棉花研究所联合
新疆生产建设兵团第七师、
新疆生产建设兵团第一师、
新疆昌吉国家农业科技园区、
江苏联发集团股份有限公司、
河南永安纺织有限公司等大型涉棉单位共同发起成立的、全国棉花生产、加工、流通、纺织、服装和贸易等市场主体和涉棉科研机构、大中专院校、行业协会、各级政府等自愿组成的、互助互利型的全国性非营利性社会组织，是以具有法律约束力的合作契约为保障，形成的“自愿联合、平等协商、互助互利、合作共赢”的合作组织。目前已有会员单位200余家。
联合棉花产业链条的优势成员单位开展以创新、诚信、务实、优质、高效、引领、示范的产业紧密合作，建立棉花科研–生产–检验–轧花加工–流通–纺织–市场的一体化运作机制和利益共同体，攻克现有体制机制相互脱节、相互制约的障碍和瓶颈，以“中高端品质”、“绿色通道”、“直通车”等快捷、便利形式实行棉花产业链各环节的有效直接对接，以技术、机制、方式、方法构建促进棉花产业深度融合与协同创新，培育发展联盟式的优势联合体，实现我国棉花全产业链各环节、各单位的有机融合，创建一种多方互利共赢的产业运行新模式，引领棉花产业发展模式的转变和升级，加快科技成果转化为现实生产力，提升我国棉花产业的核心竞争力。