图泛基因组
借助数学和计算机中被称为图的数据结构来展示一个物种所有的基因排列和结构
图泛基因组 (graph pangenome),指借助数学和计算机中被称为(graph)的数据结构来展示一个物种所有的基因排列和结构。
定义
图泛基因组 (graph pangenome)是借助数学和计算机中被称为(graph)的数据结构来展示一个物种所有的基因排列和结构。而把一个物种所有的基因都找到,并按照顺序排列,就形成了泛基因组(Pan-genome)。
应用
北京时间2022年6月8日,《自然》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队有关泛基因组的两项研究成果。
以基因组所周姚第一作者鲍志贵张智洋为共同第一作者的论文中,他们首次获得了番茄的图泛基因组,并借此找回了番茄育种中“丢失的遗传力”(遗传力丢失),为解析生物复杂性状的遗传机制提供了新思路。论文评审专家法国农业科学研究院研究员Mathilde Causse等认为,“这项工作是对图泛基因组概念最全面的分析。” “图泛基因组将可能成为基因组分析和作物基因组育种的标准,在这个意义上,这篇论文是奠基性的(foundational)”。
最新修订时间:2024-05-21 15:21
目录
概述
定义
应用
参考资料