电子商务支付系统是
电子商务系统的重要组成部分，它指的是消费者、商家和金融机构之间使用安全电子手段交换商品或服务，即把新型
支付手段（包括
电子现金（E-CA-SH）、信用卡（CREDIT CARD）、
借记卡（DEBIT CARD）、智能卡等）的支付信息通过网络安全传送到银行或相应的处理机构，来实现电子支付。
在线支付的安全性由银行方面保障，当用户选择了在线支付后，在需要填写
银行卡资料时，实际上已经离开本站
服务器，到达了到银行的支付网关。国内各大银行的支付网关，都采用了国际流行的SSL或SET方式加密，可以保障您的任何信息不会被任何人窃取。因为在线支付是在银行的支付网关中完成的，所以用户也不必担心您的银行卡资料会在经由本站泄露。
各大支付品牌也对此做出了不懈的努力，以Visa为例，Visa确保支付行业安全的策略是，促进相关利益方之间进行更紧密的合作与交流，实施多层次的安全保护。简而言之，安全是一项需要共同承担的责任，不存在任何“灵丹妙药”可以将其一网打尽。Visa认为，整个支付行业的安全性并非是由所采取的安全措施来衡量的，而是由支付系统中安全性最薄弱的环节所决定的。也就是说，提高支付系统中各个薄弱环节的抗风险能力才是有效确保整个支付行业安全性的最佳手段。 Visa是通过“三管齐下”的方式来实现其支付安全战略的： 1. 预防：通过采取安全措施防止犯罪集团及其他犯罪分子窃取支付数据。这些措施是长期计划，旨在从支付产业的长远利益考虑，加强支付基础设施的建设计划。这是一项需要持续开展的计划，目的是保护持卡人的账户数据，使其免遭欺诈罪犯的窃取，并通过采用动态
数据加密确保支付数据对犯罪分子而言失去价值。这是今后进行风险管理工作的重点领域。 2. 保护：防止犯罪集团及其他犯罪分子利用窃得的数据实施犯罪行为。保护措施包括：在不同POS环境下实施的验证计划，防止被窃账户数据的使用。该计划属于
中期计划，目的是进一步确保对
持卡人的安全保护和身份验证，确保支付系统只接受真实可信的交易。 3. 响应：通过对事件的监测和管理，减少其对支付行业的影响，为应对当前的挑战、防止进一步损失提供战术上的支持。具体包括欺诈监测、共同购物点（CPP）的侦测、对所有利益相关方的培训和教育以及促进业内互信、合作伙伴关系及合作的行动。 国际支付网络是一个重要而复杂的系统。它不断演进，以满足各种新的需要，应对各种新的挑战。因此，非常重要的一点是，业内所有机构对该系统的总体结构及概念具有清晰的了解，从而对各种威胁具有足够的认识，并采取相应的策略来应对日益严重的威胁。 除传统的金融机构客户、
特约商户和持卡人外，支付行业相关利益方还包括：服务提供商、卡片制造商、执法机构、检察机构、立法机构以及很多其他机构。在我们探索新的支付技术和方法的过程中，相关利益机构的数量将会越来越多，而我们所面临的挑战，是使所有这些相关利益方在确保最高安全标准这一总体目标下步调一致。
直接通过登录网上银行进行支付的方式。要求：有个人网上银行。开通网上银行之后的操作就不是很麻烦了，可实现
银联在线支付，信用卡网上支付等等。
第三方支付本身集成了多种支付方式，流程如下：1、将网银中的钱充值到第三方。2、在用户支付的时候通过第三方中存款进行支付。3、花费手续费进行提现。第三方的支付手段是多样的，包括移动支付和固定电话支付。
最常用的第三方支付是支付宝、财付通、贝宝、易宝支付、快钱、网银在线了，其中做为独立网商或有支付业务的网站而言，最常选择的不外乎支付宝、贝宝、易宝支付、快钱这四家。
支付宝：支付宝是国内先进的网上支付平台，由
阿里巴巴公司创办，致力于为网络交易用户提供优质的安全支付服务。支付宝服务自2003年10月18日在淘宝网推出以来，在短短的几年时间，迅速成为会员网上交易不可缺少的支付方式，深受淘宝会员喜爱。经过不断的改进，支付宝服务日趋完善。为了更好的运营支付宝，为用户提供更优质的服务，成立了支付宝公司，并于2004年12月30日推出支付宝账户系统。
支付宝有以下几种支付方式：快捷支付(含卡通)、网上银行、支付宝账户余额、货到付款、网点支付、消费卡支付、找人代付、
银联手机支付等。
快捷支付(含卡通)：是最安全、轻松的付款方式。用户通过电话或者网站等方式订购商品时，不需开通网银，直接通过输入卡面信息，即可便捷、快速地完成支付。只需将您的支付宝账户关联您的储蓄卡或者信用卡，每次付款时只需输入支付宝的支付密码即可完成付款。