基元指的是构成生物体的大分子上局部区域，模式有锌指、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋和螺旋-环-螺旋等。

motif 指构成生物体的大分子上局部区域构成特征性序列以适应大分子之间相互结合(或吻合)的基本结构单位称作基元。有时也称作模块或模式。如锌指、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋和螺旋-环-螺旋等。这些基元结构是解决基因转录调控的途径之一，也是生命科学中的重要研究课题之一。

基元，基序或模序（motifs or modules，模体符）在许多蛋白质中，有两个或三个具有二级结构的肽段在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，称为模序。有的将这种规则的二级结构的聚集体称为超二级结构，它们可直接作为三级结构的“建筑块”或域结构的组成单位，是蛋白质发挥特定功能的基础。

类型：αα、ββ、αβα、锌指结构、亮氨酸拉链

在反式作用因子的结构中，基序一般指构成任何一种特征序列的基本结构，作为结构域中的亚单元，其功能是体现结构域的多种生物学作用。

反式作用因子的DNA结合结构域(DNA binding domain)中的几种常见基序：

①螺旋/转角/螺旋（Helix-turn-helix,HTH）基序

两段螺旋被一短的转角结构分开，其中一段螺旋为DNA识别螺旋。

同源异形结构域(Homeodomain，由同源异形盒编码)中含有HTH基序。具有Homeodomain的转录调控蛋白在胚胎发育和正常细胞分化的基因表达调节中有重要作用。

②锌指(Zinc finger)基序

由肽链的保守序列中的一对组氨酸加一对半胱氨酸(His2/Cys2)或2对半胱氨酸(cys2/cys2)与一个锌离子形成配位键，这些氨基酸对之间的多肤链成环状突出并折迭成指形结构，多个指结构常串联重复。

锌指族转录因子以二聚体形式同DNA上的顺式调控元件结合。

含锌指基序的转录因子：与GC盒结合的SPl、类固醇激素受体家族，抑癌蛋白WT1等。

③亮氨酸拉链(Leucine-Zipper)基序

由一段每隔6个a a 就有一个Leu的伸展肽链组成，这些周期性出现的Leu都位于α—螺旋的同—侧面，因此两条均含Leu拉链基序的蛋白质通过亮氨酸侧链的相互作用形成二聚体。

具有亮氨酸拉链基序的转录因子：原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族)。

④螺旋-环-螺旋(Helix-loop-Helix，HLHt)基序

由2个α螺旋间隔一个非螺旋的环(loop)组成。如原癌基因产物C-myc及其结合蛋白Max。

(二)组成光学掩模版阵列中的任一部分。可用作制造单个集成电路的功能层，或供测试用。