复旦大学神经生物学研究所，成立于2001年4月，是直接隶属
复旦大学的基础科学研究所。现有固定人员17人，其中教授7名，副教授/高级工程师2名 （包括
中国科学院院士1名）。所长
杨雄里院士。
神经生物学研究所主要从事
突触传递和调控、感觉信息处理、学习和记忆、神经退行性疾病等研究。
建所以来，神经生物学研究所在科学研究、学科建设、承担国家重大和重点项目、队伍建设、人才培养、学术交流等各方面均取得显著成绩。在历年的学校理（医）科科研业绩的综合评估中，神经生物学研究所人均科技产出在全校各单位中名列前茅。
在科学研究方面，神经生物学研究所绝大部分通讯作者论文的发表在SCI索引的国际学术期刊，其中约1/3的研究论文发表在影响因子大于3.5的杂志（神经科学领域发表原始论文排名前15%的杂志）， 包括Neuron，Journal of Neuroscience，Progress in Neurobiology等顶尖杂志。获得省部级科研奖励7项，包括上海市自然科学奖、教育部自然科学一等奖各1项，以及教育部提名国家自然科学一等奖1项。
在学科建设方面，神经生物学研究所作为主要力量之一，积极参与复旦大学的神经生物学学科建设，发挥了重要作用。神经生物学在全国重点学科评审中名列第一。“
211工程”学科建设项目“脑功能的基础和相关疾病的机制研究”圆满通过验收。“
985”二期科技创新平台“脑功能和脑重大疾病的基础和应用基础研究”暨脑科学研究院已通过教育部和学校的论证，并已正式启动。 在上述工作中，神经生物学研究所主持了大量的申报、筹备和组织工作，进一步提升了复旦大学脑科学研究在国际、国内学术界的地位和影响。
在科研项目的实施和申请方面，神经生物学研究所作为首席科学家单位的“973”项目“脑功能和脑重大疾病的基础研究”在2004年圆满通过科技部验收，在“人口与健康”领域同年结题的6个项目中排名第一，该项目的实施有力地推动了我国
神经科学的发展，培养了一批杰出的青年科学家。在此项目的基础上申请并获立项的2005年度973项目有2个（“脑功能的动态平衡调控”、“神经变性病的机制和防治的基础研究”）。目前，我所研究人员作为项目负责人、课题组长或学术骨干承担的重大项目包括：“973”项目、国家自然科学基金委重点项目、国家科技部“863”项目、
国家杰出青年科学基金（A类和B类）、国家自然科学基金委面上项目，以及上海市科委重大项目和重点项目。
在队伍建设和人才培养方面，我所入选
国家杰出青年科学基金获得者4名，入选教育部科技创新团队2名，从海外引进全职教授2名、副研究员2名，培养了一大批硕士研究生、
博士研究生及博士后。