山东省齐鲁足球超级联赛其前身齐鲁业余足球超级联赛创办于2015年，2019年更名为山东省业余足球超级联赛，2023年更名为山东省齐鲁足球超级联赛。

2015年，山东省足球运动协会创办齐鲁业余足球超级联赛，简称“齐鲁超赛”。2015年和2016年，联赛采用主客场双循环赛制。2017年联赛延伸至16市会员协会，采用分区赛和决赛，分区赛采用赛会制，决赛阶段采用主客场双循环赛制。2018年，联赛采用赛会制的分组淘汰赛。

2019年，山东省足球运动协会与山东鲁能泰山足球俱乐部联合主办，鲁能体育产业公司承办，赛事遂更名为山东省业余足球超级联赛，简称“山东业超”。

2020年，为了市县级业余足球联赛更好地与省级联赛有序衔接，省足协对全省业余比赛竞赛体系进行统一规范，市级联赛冠名为“山东省业余足球甲级联赛（XX赛区）”，区县市联赛冠名为“山东省业余足球乙级联赛（XX赛区）”。

2022赛季（2023年补办）开始，山东省足球运动协会与山东广播电视台体育节目中心联合主办，山东体育频道发展有限公司承办。

2023年更为山东省齐鲁足球超级联赛。

2024年增加女子组别。自2024年起，男子组凡不举办市级联赛或不被省足协认可的配套支撑赛事的市级会员协会，将不再分配参赛名额。