崇圣祠，也称“启圣殿”、“启圣祠”，位于大成殿正后方，正殿五间，为主祀孔子之父叔梁纥之殿。清雍正元年（1723），将“启圣祠”改称为“崇圣祠”。

崇圣祠原称启圣祠，主祭孔子父亲叔梁纥，清雍正元年（1723年）追封孔子五代祖先为王爵并予入祀，才更名为崇圣祠。位于本市左营区旧城国小内，是经由内政部核定的三级古迹。旧孔庙是于清康熙二十年三年﹝西元1684年﹞由凤山首任知县杨芳声所创建。后来因风雨损坏，于乾隆及光绪年间皆有修建，终于形成完整的规模。

但是，很可惜的是，到了日据时代，日本人于庙内兴设「旧城公学校」﹝旧城国小的前身﹞，使原有庙貌再被毁坏。光复后只剩这一座崇圣祠。

而所看到得崇圣祠，是近年来政府为加强古迹维护，依照原貌加以整修；并将散近的石碑收集起来，重新立于祠后，成为碑林，以利永置附久保存。收藏昔时左营各地旧聚落遗留下来的石碑，碑林原有十六块石碑，但有六块已散失，现仅存十块碑石，自左而右是「潮军义勇祠」、「重建学宫碑记」、「卧碑」、「功德碑记」、「南协游府丁公去思碑记」、「藩断牛埔界址严禁侵占番地碑记」、「奉旨圣表忠义碑记」、「谕封孔子五代王爵并合祀碑记」、「新建明伦堂碑记」、「凤山县孔子庙下马碑」。其中最右侧刻有「古文武官员人等至此下马」碑文的「下马碑」，显示文武官员对孔庙的敬重，这也是孔庙特有的形制，现今祠前左方有拴马之石柱可做参考。左侧还有较低矮的「卧碑」，碑文内容为学童遵守的规范教条，高度则考量孩童的兴高而设置，相当的特别。

崇圣祠的现貌最具特色的是依然保存了大木结构。柱珠位于柱子之下，因为木柱的柱脚易受潮湿而腐烂，故木柱下置柱珠以防地湿，且腐烂时易抽换而不影响整个结构体，后来逐渐演变成为柱子的收头，具有装饰的用途。另外在柱珠下有正方形石块，可承受柱子下压之重量，称为「磉石」。屋顶上则有陶烧龙饰及葫芦，也是旧建筑的特色。

崇圣祠奉祀孔子上五代祖先，并以四配之父及宋代理学家周、张、程、宋、蔡之父配享从祀。唐开元二十七年（739年）命以孔子弟子从祀，颜无繇、颜回父子与曾　、曾参父子均从祀孔庙，但颜回位列十哲，塑像坐于堂上，曾参因孝道可崇，塑像坐于十哲之后，而颜无繇、曾因事迹不突出只能于墙上画像。子处父上，从宋代起就受到一些人的指责。明嘉靖九年（1530年），采纳张璁的建议，命国学及天下学校均建启圣公祠，主祭孔子之父叔梁纥，并以颜回之父颜无繇、曾参之父曾点、孔伋之父孔鲤、孟轲之父孟孙激配享，程颢、程颐之父程向、朱熹之父朱松、蔡沈之父蔡元定从祀，明万历二十三年（1595年）又增加周敦颐之父周辅成从祀。清雍正元年（1723年），世宗追封孔子上五代王爵，命将启圣祠改称崇圣祠以奉祀。曲阜孔庙因有家庙性质，启圣祠且有寝殿，于是将孔庙东路家庙改作崇圣祠，奉祀孔子五代先人，并将原启圣祠配祀先贤先儒移入崇圣祠。崇圣祠正中供奉孔子五代祖肇圣王木金父，东侧向外依次供奉高祖裕圣王祈父、祖父昌圣王伯夏，西侧向外依次供奉曾祖诒圣王防叔、启圣王叔梁纥，均面南。东面面西供奉颜无繇、孔鲤，西面面东供奉曾、孟孙激；东面再外供奉周辅成、程向、蔡元定，西面再外供奉张迪、朱松。 肇圣王木金父、裕圣王祈父、诒圣王防叔、昌圣王伯夏均为清雍正元年追封，启圣王叔梁纥于宋大中祥符元年（1008年）追封为齐国公，建专祠于曲阜孔庙，元至顺元年（1330年）加封为启圣王，明改称启圣公，嘉靖九年从祀于全国各地学校，清雍正元年复封为启圣王。

颜无繇，字路，颜回之父，唐开元二十七年从祀孔庙，追封杞伯，宋大中祥符二年（1009年）加封曲阜侯，元元统三年（1335年）加封杞国公，谥“文裕”，明嘉靖九年改称先贤，入启圣祠配享，清雍正元年改祀崇圣祠。

曾点，字晳，曾参之父，唐开元二十七年从祀孔庙，追封宿伯，宋大中祥符二年加封莱芜侯，明嘉靖九年入启圣祠配享，称先贤，清雍正元年改祀崇圣祠。

孔鲤，字伯鱼，孔伋之父，宋崇宁元年（1102年）追封泗水侯，宋咸淳三年（1267年）入祀孔子庙，明嘉靖九年配享启圣祠，称先贤，清雍正元年改祀崇圣祠。

孟孙激，字公宜，孟子之父，元延?三年（1316年）追封邾国公，明嘉靖九年配享启圣祠，称先贤，清雍正元年改祀崇圣祠。

周辅成，周敦颐之父，字伯大，宋代人，曾官桂岭令，赠谏议大夫。明万历二十三年从祀启圣祠，称先儒，清雍正元年改祀崇圣祠。

张迪，张载之父，宋代人，曾官涪州知州，赠都官尚书郎中。清雍正二年命从祀崇圣祠，称先儒。

程向，程颢、程颐之父，字伯温，宋仁宗时曾官龚州知州，累转大中大夫，封永年县开国伯。明嘉靖九年从祀启圣祠，称先儒，清雍正元年改祀崇圣祠。

朱松，朱熹之父，字乔年，宋代人，曾官知饶州，主管台州崇道观。元至正二十一年（1361年）追谥“献靖”，次年追赠齐国公。明嘉靖九年从祀启圣祠，称先儒，清雍正元年改祀崇圣祠。

蔡元定，蔡沈之父，字季通，宋代人，嘉定三年（1210年）赠迪功郎，谥“文节”。明嘉靖九年从祀启圣祠，称先儒，清雍正元年改祀崇圣祠

《钦定国子监志》载“崇圣祠在大成殿后，正殿五间，高三丈一尺八寸五分，中广一丈六尺五寸，左右各广一丈三尺三寸，深二丈六尺，基高五尺七寸。前有月台一，高五尺五寸，广四丈九尺，深二丈五尺三寸。三出陛，前及左右各一，阶十有一级。……中为门三间，高二丈六尺八寸，中广一丈三尺五寸，左右各广一丈一尺五寸，深一丈八尺。左右门各一，门外西折，有门一间西向。正殿、正门均覆绿琉璃瓦，两庑甬瓦瓦，门楹丹艧 ”。