微生物群落是指在一定区域里，或一定
生境里，各种微生物种群相互松散结合，或有组织紧凑结合的一种结构单位。
微生物群落是广泛存在于
生态系统中的一种结构单位和功能单位，它们是生态系统内充满生气的一部分， 微生物群落中各种不同的
种群能以有规律的方式共处，同时它们具有各自明显的营养和代谢类型。从某种意义上说， 微生物群落的发展导致了生物的发展。
人们对于微生物群落的认识多基于传统微生物学方法,并结合
生物化学、
分子生物学和
遗传学等方法,分析
群落中可培养微生物分布与功能。但是,已培养的
微生物可能不到
自然界