南京微结构国家实验室前身是南京大学固体微结构物理实验室(Laboratory of Solid State Microstructure, Nanjing University),该实验室（Laboratory of Solid State Microstructure, Nanjing University）曾被英国《自然》（Nature）杂志列为除日本以外的东亚地区“已接近世界级水平”的两个科研机构之一，被美国科学情报研究所（Institute for Scientific Information）列为中国大陆实验室榜首。

实验室中文名称：南京微结构国家实验室（筹）

实验室英文名称：Nanjing Nation Laboratory of Microstructures

国家自然科学基金重大项目3项。同时，主持承担973计划课题24项, 863计划课题14项，教育部学科创新引智计划1项等, 重大、重点基金23项，已经具备了冲击相关领域国际最高学术水平的基础。

1 . 南京大学固体微结构物理实验室的前身是南京大学固体物理研究所，依托南京大学物理系。

2 .1984年，改建为南京大学固体微结构物理国家重点实验室。

3 .2004年10月，获美国唐氏基金会5000万元捐赠，拟协同中国科技部、教育部、江苏省政府和南京大学等多方资金，与南京大学现代配位化学国家实验室等为基础组建南京微结构国家实验室，并将微结构光电功能材料与器件、先进电子材料与微结构器件、分子及聚集体的组装和结构、软物质的微结构、微结构设计与性能预测作为实验室的主要研究方向。

4 .2005年4月，南京大学微结构国家实验室大楼——“唐仲英楼”奠基。

5 .南京微结构国家实验室自2006年依托南京大学开始筹建，江苏省科技厅将其列入省重大研发机构管理，同年底被国家科技部批准列入国家实验室筹建试点计划。

6 .2009年该实验室被科技部定为“量子调控”领域唯一国家实验室，量子调控研究成为实验室核心科研工作。

7 .2010年2月，实验室成功地将低温扫描隧道显微镜自主研制成自旋极化扫描隧道显微镜（Spin-polarized STM），成为世界上极少数掌握此项技术的实验室之一，标志着我国自旋极化扫描隧道显微技术迈入世界先进行列。

人工微结构科学与工程研究部

量子调控的电子学研究部

分子基光电功能体系研究部

超分子和纳米结构及其器件研究部

软物质的结构与功能研究部

基于微结构的高新技术及其应用研究部

微结构材料设计和理论计算研究部

目前，实验室的主要研究内容为以下七个方向：1、人工微结构物理与工程学、2、量子调控的电子学、3、分子基光电功能体系 、4、超分子和纳米结构及其器件、5、软物质的结构与功能、6、微结构材料设计和理论计算、7、基于微结构的高新技术及其应用。