总理事会同时负责履行《争端解决谅解》规定的争端解决机构的职责和贸易政策审议机构的职责。但争端解决机构和贸易政策审议机构各自有自己的主席。

世界贸易组织总理事会由所有成员的代表组成，并向部长级会议报告工作。在部长级会议休会期间，总理事会负责行使部长级会议的职能。

总理事会负责与同WTO有关的政府间组织和非政府组织的联系和合作。

总理事会下设货物理事会、服务理事会、与贸易有关的知识产权理事会及各委员会和工作组。除8月份WTO休会期外，总理事会通常每两个月召开一次会议，听取下属机构的工作报告，并就下属机构提交或总理事会自身认定的重要事项作出决定。在多边贸易谈判期间，总理事会还指导和监督谈判的进行。鉴于其地位和职能的重要性，总理事会通常由各成员大使或常驻代表率团出席。

总理事会主席由发达成员和发展中成员轮流担任，任期一般为一年，现任主席为乌拉圭常驻WTO大使卡斯蒂罗。