慧灵女中的前身为美国南浸信会西差会（亦称浸礼会差会）于光绪三十三年创办的慧灵小学，创办人蓝纱斐女士，宣统三年（1911）迁址临顿路谢衙前，改名为慧灵女中。

慧灵女中系苏州市第三中学前身，当时由晏成中学和慧灵女中组成。晏成中学的前身为美国南浸信会西差会（亦称浸礼会差会）于光绪三十二年（1906）创办的浸会小学，创办人麦嘉祺，宣统元年（1909）迁址临顿路谢衙前，增设中学部，民国2年（1913）改名为晏成中学。于光绪三十三年创办的慧灵小学，创办人蓝纱斐女士，宣统三年（1911）迁址临顿路谢衙前，改名为慧灵女中。民国26年卢沟桥事变后，两校曾迁沪，与上海晏摩氏中学合并成浸会联合中学。翌年，部分教师借晏成校舍开办“成智私塾”。 1942年又由汪伪教育厅先后办“江苏省立联合中学”、“江苏省立教育学院”及其附中，抗日战争胜利后解散，晏、慧回苏复校。解放后，因晏成校址被借办康复医院，两校合并于慧灵女中，一度称晏慧中学。1953年1月，人民政府接办为公校，定名为“苏州市第三中学”。

图为民国时期慧灵女中校舍，外观三层，水泥外墙，六根罗马柱支撑，结构对称稳健，时代特征明显。现无存。

1906年（光绪三十二年），美国南浸信会西差会创办浸会小学，创办人为麦嘉祺先生。

1909年（宣统元年）迁址临顿路谢衙前，增设中学部。

1913年 改名为晏成中学。

1907年（光绪三十三年）美国南浸信会西差会创办慧灵小学，创办人为兰纱裴女士。

1911年（宣统三年）迁址临顿路谢衙前，改名为慧灵女中。民国初年，梁启超、蔡元培、章太炎等名人曾到学校讲学；

1919年孙中山先生为晏成中学题写“其道大光”的匾额；在中西文化融合中，学校一度形成自己的办学特色，尤以外语与体育见长。

1936年程金冠代表中国参加柏林奥运会。但是，由于国民时期，战争频繁，社会动荡，两校几经变迁，教育教学不免受到影响。

1953年 1月，人民政府接办为公校，遂定名为“苏州市第三中学校”。

1960年 学校被中共江苏省委命名为江苏省重点中学，并被确定为“五年一贯制”试点学校。 20世纪90年代，学校深化教育改革，实现了跨越式的发展。

1996年苏州三中与市三十九中合并办学；同年，经市政府批准，创建了苏州市第一所国有民办公助性质的全日制中学——平江中学。1998年，苏州三中正式恢复“江苏省重点中学”称号。

2000年 平江中学与母体苏州三中分离，迁址西北街，并租赁光明丝织厂的部分厂房作为校舍。

2003年 苏州三中与市二十一中合并办学，探索集团化办学的新模式，合并后的二十一中校区作为平江中学的一个分部。

2004年 平江中学及其分部（原二十一中）两校区一起迁址学士街389号，形成“一校三区”的办学格局。同年，苏州三中高中部通过了江苏省四星级高中评估组专家的验收，晋升为江苏省四星级高中。

2006年 苏州三中又与市一初中合并办学，并将苏州三中初中部（原三十九中校区）迁至原市一初中校区，作为苏州三中的初中部，增设平江中学二部。

2007年 苏州三中又与通才中学实行紧密型合作办学。

苏州三中现有三个校区——南校区（高中部）、东校区（初中部）和西校区（民办性的平江中学）。其中，南校区毗邻世界文化遗产、古典名园——狮子林 ，是一座园林式的校园，校园内耸立着弘道楼、逸夫楼、成林楼、纵横楼，而中山苑、弘泽园、麦兰园、璞石成器等景观镶嵌其间，传统文化与现代文明和谐结合，恬淡、典雅。东校区是一座古典园林式的校园，内有被誉为“小林屋洞”的小花园和明清时期的建筑——惠荫书院，环境优美典雅，文化气息浓郁。平江中学位于学士街389号，内有王鏊古居、慧成楼、学士楼等。

现三校区共计学生4600多人，在职教职工530多人。学校拥有140869册图书，每年订阅160多种期刊、60多种报纸；建有千兆校园网，是一所设备先进的现代化学校。 随着办学规模的扩大，学校形成了“本部领导，校区办学、部办服务”的管理模式，形成行政、学术、督导三支队伍，努力构建现代学校制度。

校训：“学道爱人”

校风：“严谨、求实、团结、创新”

办学宗旨：一切为了学生的发展”

办学目标：“让学生更聪颖、更健康、更有创新能力”

教育理念：“关爱每个学生，服务每一个家庭”

办学追求：“弘扬百年优良办学传统，再创新百年育人伟绩”。

20世纪80年代，外语教研组在初中英语教学中进行“情景教学”的实践，90年代，学校深化教学改革，涌现出了英语特级教师赵晴芳等有教学特色的优秀教师，在她带领下，学校积极探索外语特色之路，率先在苏州市开设双语课，率先在苏州市成立国际教育交流处，并与日本、美国、加拿大、法国等学校建立友好关系，2004年，苏州三中成为“中央教科所外国语实验学校”，2007年，学校被评为中央教科所的优秀外语实验学校，外语特色现已成为苏州市的知名品牌。

1976年，苏州三中建立了地震测报站，历经几代人的努力，坚持了下来，并成为全国中学系统中的“独此一家”，1997年4月，钟连元同志任苏州三中校长后，将逸夫楼建设成为科技中心，并建立了以地震科普教育为龙头的多学科结合的科技创新教育体系。2005年，学校成功地举办了第二十八届国际科联大会的分会场活动；国务院总理温家宝深情寄语苏州三中：“希望学校把科技活动继续搞好，使青少年热爱科学、勇于创新的风气推广开来。”为了认真落实温总理的批示，学校开展“科普知识进课程、科普专家进课堂”的“双进”活动，建立了南京紫金山天文台苏州三中科普教育基地，组织学生开展科技夏令营。2007年，苏州三中开展电脑机器人援藏行动，在全国引起很大的反响。近年来，学生在各级各类科技创新比赛中屡屡获得大奖。

2003年，苏州三中进行“市队校办”体制改革，推动了学校体育工作的发展，教工男篮勇获苏州市教工篮球赛“三连冠”，学生女子篮球队参加国内外比赛屡获奖牌。尤其引人注目是张晓一同学，2006年他获亚洲青年田径锦标赛跳远冠军，后入选国家田径集训队，备战2008年北京奥运会。

学校成功举办全国五省二区一市孙中山教育思想研究会；编号为5013的小行星被国际小行星命名委员会命名为“苏州三中星”；学校获“全国中小学现代技术实验学校”、首批“国家防震减灾科普基地”、“江苏省文明单位”、“江苏省中小学德育工作先进集体”、“江苏省青少年科技教育特色学校”、“江苏省青少年科技活动五星级先进集体”、“苏州市双语实验学校”、“苏州市教科研先进学校”、“苏州市校务公开先进学校”等上百个荣誉称号。2006年12月，诺贝尔奖获得者、著名物理学家李政道博士参观苏州三中后欣然题写：“凝聚姑苏灵气，汇成全国骄傲。”这是对苏州三中的最高评价。

国务院副总理、外交部长吴学谦，有陆道培、殷瑞珏、王礼恒等8位两院院士。

著名脑外科专家杜子威。

著名桥梁专家任旭初。

著名作家苏童。

著名歌唱家顾欣。

著名教育家于漪等。