击败了汪达尔·萨维奇之后，鹰侠和鹰女离开了团队。时间之主理事会已经被摧毁，传奇小队决定肩负起保护历史的责任。然而美国正义协会领袖时侠雷克斯.泰勒（
帕特里克·J·亚当斯饰）突然出现，警告传奇小队不要登上乘波号，否则他们都会死亡。最终传奇小队无视了雷克斯.泰勒的警告，时间穿越回了1942年的纽约。
历史学家内特·海伍德博士（
尼克·扎诺饰）找到市长即绿箭侠奥利弗·奎恩（
斯蒂芬·阿梅尔饰），需要其帮助寻找失踪的乘波号及上面的人员。二人在大西洋水域海底找到了沉没的乘波号以及船上的唯一幸存人员但是处于静止状态的米克·罗里（
多米尼克·珀塞尔饰）。醒来后的米克告诉他们，达米恩·达克（
尼尔·麦克唐纳饰）在1942年与纳粹合作制造了一颗原子弹并向纽约发射，船长里普·亨特（
亚瑟·达维尔饰）决定将传奇小队成员时间分散到整个历史时期，而他自己却留在乘波号上，阻挡达克的原子弹路线，拯救了纽约免遭灭顶之灾。米克由于在行动中受伤被设置进入静止状态，所以没有像其他队友一样被分散转移。但里普却失踪了，米克不知道队友们都被时间分散去了哪里，内特想办法解救出了传奇小队成员并将他们重新聚集起来，但群龙无首，最终由莎拉·兰斯（
凯蒂·洛茨饰）暂代船长之职。
之后，传奇小队与1942年的美国正义协会相遇，美国正义协会成员雌狐阿玛雅·吉韦（
麦茜·理查德森·塞勒斯饰）也加入了团队。而反派马尔科姆·梅林（
约翰·巴洛曼饰）与达米恩·达克、逆闪电艾尔伯德·斯旺（
马特·莱斯切尔饰）、寒冷队长莱纳德·史纳特（
温特沃斯·米勒饰）则组成了末日军团，妄图利用命运之矛改变现实。传奇小队必须采取行动去阻止末日军团抢夺命运之矛。
2016年3月13日，CW电视台宣布续订第二季共13集；4月27日，编剧兼制片人菲尔·柯尔摩公布第二季的拍摄计划；6月16日，CW电视台公布尼克·扎诺作为常规演员加入第二季以及温特沃斯·米勒的回归；7月18日，公布该剧开拍及第一集的标题；7月23日，剧组主创出席2016年圣迭戈动漫展；9月22日，CW电视台发布第二季海报；11月10日，CW电视台宣布第二季追加续订4集；12月23日，CW发布该剧余下剧集的预告片。
就像传奇们本身一样，该剧的首播也希望将自己的时间线重新设定为它本来的样子——与一队拥有超能力的英雄和恶棍一起进行一场有趣、疯狂、歌剧般的时空之旅。第一季被软弱的反派和被迫的爱情故事所拖累，但第二季似乎准备丢弃那些华而不实，加入一些精彩的喜剧时刻，这一点正是第一季如此有趣的原因。该剧最棒的地方在于团队本身以及他们讽刺的、诙谐的互动和笑话。当剧中缺少搞笑片段的时候，就没有什么好看的了。该剧将《闪电侠》和《绿箭侠》中的这些次要角色组合在一起，制作自己的电视剧的目的是让他们有机会成为超过3集的背景角色。现在，该剧在这个前提下又进一步扩大了反派的规模，把闪电侠和绿箭侠的反派拼凑成一个完整的末日军团。结果，随着时间之主的替代者和时间大盗们在历史中搏斗（很少有关于未来的，因为如果他们坚持中世纪或20世纪中期的西方标准的话，服装造型会更容易），这一次他们会觉得可以更自由地表现出滑稽而不是严肃演出。第二季还通过一个固定下来的人物引入了一个新的角色,尼克·扎诺饰演的恰好是一位历史学家,他实际上可以协助传奇们规划任务,而不仅仅是奔跑,还开着激光枪（因为众所周知，里普·亨特一直是个糟糕的领导者）。尽管该剧一开始就跳入了与纳粹的斗争中，这也是观众们最喜欢的时间旅行的起点，但它在选择上也很圆滑。对于那些在经历了令人失望的第一季之后放弃《明日传奇》的观众们来说，这个故事可能最终会得到应有的公正对待。（Collider评）