此类酶有两种机理,分别是以水(水解活性)或以
无机磷酸盐(磷酸解活性)去破坏RNA上的核苷酸-核苷酸键。水解核糖核酸外切酶分类在EC3.1中,因以水去降解RNA,因此生成
单磷酸腺苷;而以无机磷酸盐降解的则因有外在磷酸盐加在生成分子上,因此形成
二磷酸腺苷。
核糖核酸外切酶存在于所有生命的界别,包括细菌、古菌及所有真核生物。能对不同类别的RNA种类作用,包括
信使RNA、tRNA、
核糖体RNA及微RNA。核糖核酸外切酶可简单如单个蛋白质分子的(如),亦可以复杂至包含多个蛋白质分子的
外切体复合物(当中包括核糖核酸外切酶的四个家族)。