母质层又称C层，是指土层下部的层次，是未经受土壤发育过程的显著影响的土壤母质。

母质层是指土壤剖面下部的层次，位于淀积层和母岩层之间，是未经受土壤发育过程的显著影响的土壤母质。由岩石风化碎屑残积物或运积物构成，很少受生物作用影响，成土作用不明显，基本上保持着母岩的特点。因此严格地讲，母质层不属于土壤发生层，因为其特性并非土壤形成作用所产生。母质层以C表示。根据风化程度和碎屑物特征，可分为C1、C2等亚层。

母质层位于土壤剖面淀积层(B层)以下的土层。它相当于耕作土壤的底土层。系堆积的土壤母质，尚未受到土壤发生发育过程的显著影响。在自然土壤剖面中称为C层。它对于整个土壤的吸收、排水以及养分的供应等都有一定的关系。并对于土壤肥力的形成发育有着密切的影响。母质和表土及心土层，三者对土壤水、肥、气、热等因素是相互联系，相互影响，不可分割的整体。

土壤母质的下面，如果是未风化的基岩，称为基岩层，简称R层。

土壤发生层分化越明显，即上下层之间的差别越大，表示土体的非均一性愈显著，土壤的发育度愈高。在发生上有内在联系的不同发生层的垂直序列组合称为土体构型。土体构型与土壤剖面构型相当，但前者一般不包括非土壤的母质层或母岩层。

母质层在土体下部没有产生明显的成土作用的土层，由风化程度不同的岩石风化物或各种地质沉积物所构成。根据风化程度和碎屑物特征，可分为C1、C2等亚层。则母质层依据盐的种类可主要分为：

CC层：母质层中有碳酸盐的聚积层；

CS层：母质层中有硫酸盐的聚积层。

母质是形成土壤的物质基础，是土壤的“骨架”，是土壤中植物所需矿质养分的最初来源。母质层中的某些性质，如机械性质、渗透性、矿物组成和化学特性等都直接影响成土过程的速度和方向。

母质层的机械组成直接影响到土壤的机械组成，如黄土母质层由于本身的特点是质地细匀，上下一致，所以在此母质层上形成的土壤也必然保留了黄土母质的特点。

母质层中的矿物、化学成分影响着成土过程的速度、性质和方向，如在酸性花岗岩风化物中，由于石英质量分数较高，而所含的盐基成分(Na2O、K2O、CaO、MgO)较少，在强淋溶下极易完全淋失，使土壤呈酸性反应。而富含盐基的基性岩或中性岩，如玄武岩、辉绿岩等风化物形成的土壤则多为中性。

母质层中的母质的透水性对成土作用有显著影响。水分在土体中的移动，是促进剖面层次分化的重要因子。沙质母质，透水性强，而不易引起母质中的化学风化作用，故其成土作用缓慢，土壤剖面不易发育。壤性母质，有适当的透水性，母质层可以充分进行化学分解，分解产物又能随水下移淀积，从而发生较为明显的层次分化。黏质的母质，则由于透水不良，水分在土壤中移动缓慢，土壤物质由上而下的垂直移动现象不显著，而且有时还能出现潜育化现象。

此外，母质层层次的不均一性不仅直接影响土体的机械组成和化学组成的不均一性，更重要的是造成水分在土体中的运行状况的不均一性，从而影响着土体中物质迁移的不均一性。一般来说，成土过程进行得愈久，母质层中的母质与土壤的性质差异也愈大。但母质层的某些性质却会长期保留在土壤中。