民政长官后藤新平生于1857年，1876年取得医师资格，1886年任日本内务省卫生局局长。由于他跟军中的儿玉源太郎大将关系甚好，1898年他随儿玉源太郎到台湾任总督府民政长官，任职长达8年。1903年，后藤新平因屠杀台湾抗日人士、掠夺台湾资源有功，被明治天皇敕选为贵族院议员。

民政长官为台湾日据时期台湾各项政策的实际执行官僚，1919年8月20日改名为总务长官。因为台湾总督权力极大，相对身为左右手的民政长官也拥有立法、行政、司法的权力。

民政局长官：1895年5月21日

民政局长：1896年4月1日

民政长官：1898年6月20日

总务长官：1919年8月20日

历任民政长官（总务长官）18人，名单及其重要事迹如下：

1、水野遵（1895.5.21 - 1897.7.20）：曾著《征蕃私记》鼓吹征台。1895年受明治政府任命为公使，全权负责与李经方办理交割台湾后续事宜，兼任代民政局长。1896年4月1日奉派为首任民政局长。离职后升任日本拓殖务省次官（次长）。

2、曾根静夫（1897.7.20 - 1898.3.2）：任期任务多为负责绥抚台湾。

3、后藤新平（1898.3.2 - 1906.11.13）：最负盛名，也是任期最久的民政长官。1898年3月2日上任，1906年11月13日卸任，长达8年多。他任内实施土地调查，人口普查，渐禁鸦片，铁道路修筑，港口建设，确认专卖制度等。因为当时儿玉总督时常不在台湾，因此，他实际是那段时间的台湾统治者。咸信，他是使台湾对日本是负资产转变为正资产的关键人物。

4、祝辰巳（1906.11.13 - 1908.5.22）：1896年即担任台湾总督府关税课长，统筹各国领事关税业务。不久，历任该总督府财政局长，专卖局长与殖产局长等。为总督府的技术官僚之一。因颇有治绩，1906年年末升任民政长官，继续掌管台湾民生业务。1908年5月死于任内。

5、大岛久满次（1908.5.30 - 1910.7.27）：1897年任台湾总督府法务课长。不久，转任警务系统，任台湾总督府警察本署署长（后改为台湾总督府警视厅长）。因绥抚镇压台湾反日势力颇有战功，1903年升任台湾总督府担任参事官，总务局长。1908年5月，升任台湾总督府民政长官。1910年因其所属派系贪污而引咎辞职。任内多以镇压手段压制台湾反日运动。

6、宫尾舜治（1910.7.27 - 1910.8.22）：1901年进入台湾总督府担任技术官僚。后累功晋升至殖产局长兼专卖局长及彩票局长。曾发行乐透彩票（基本上票值分4种）为台湾建设筹款。1910年7月继任民政长官（前长官大岛久满次因为贪污下台）。但任期只有一个月。

7、内田嘉吉（1910.8.22 - 1915.10.20）：1910年8月自拓殖局第一部长调职台湾任民政长官兼临时糖务局长、土木部长、铁道部长，1915年10月20日，由于与安东贞美总督理念不合而离职。任内正是总督府以武力镇压台湾人最甚的期间，又发生噍吧哖等事件，台湾人受株连者颇多。1923年9月担任台湾总督。

8、下村宏（1915.10.20 - 1921.7.11）：1915年受台湾总督安东贞美所托，担任台湾总督府民政长官一职。任内，民政长官更名为总务长官，推翻多项前人苛政，在治理台湾上颇有佳绩。

9、贺来佐贺太郎（1921.7.12 - 1924.9.19）：1903年任台湾总督府递信局课长。1914年出任专卖局长，1921年升任总务长官。

10、后藤文夫（1924.9.22 - 1928.6.26）：1923年任警保局长。1924年9月因日本宪政会派系推荐，以未历练台湾总督府任何职位的资历担任总务长官，引起总督府部分官员提出辞呈。1928年，因台中不敬事件而引咎辞职。

11、河原田稼吉（1928.6.26 - 1929.8.3）：1909年进入内务省台湾课（台湾总督府的中央主管机关）担任基层官员。1915年，转入警务系统，担任熊本、长崎警部长，1922年，入中央机关的保安课长，任内结识川村竹治，并成为麾下幕僚。1928年，川村担任台湾总督，人命河原为总务长官。离职后曾任内相。

12、人见次郎（1929.8.3 - 1931.1.16）：1916年因担任农务课长成为石冢英藏的幕僚。1929年8月，石冢担任台湾总督后，邀请人见次郎担任总务长官。后因为在雾社事件中使用军事手段与毒气被解职。

13、高桥守雄（1931.1.17 - 1931.4.14）：出身于台湾总督府警务系统。1931年1月接任台湾总督府总务长官，后因处里不当，发生二次雾社事件，遭到解职。

14、木下信（1931.4.15 - 1932.1.12）：1924年进入台湾总督府任内务局长。1927年，被民政党推荐升任总务长官，但并未获选。之后，回日本鸟取县担任知事。1931年4月，再获政党推荐任总务长官。但因随后日本内阁政党轮替，下台。

15、平冢广义（1932.1.13 - 1936.9.2）：1902年毕业后进入内政警务系统，历任神奈川、爱媛、兵库等地警务部长。1932年1月，接任台湾总督府总务长官，为了实施南进政策，改革台湾地方制度，大胆起用台籍基层官员，推广日语，台日婚姻制度合法化等同化政策。后因治绩于1939年当选贵族院议员。

16、森冈二朗（1936.9.3 - 1940.11.26）：1911年毕业后历任岛根、青森等县知事，朝鲜总督府警务局长等职。1936年9月接任台湾总督府总务长官。中日战争全面爆发后为了让台湾成为南进政策的基地，废止汉文流通，鼓励台人改姓改名，并开始实施战时物资的配给与管制，任内曾涉及盐水港制糖贪污案件。

17、斋藤树（1940.11.27 - 1945.1.5）：原任日本国警视厅总监。1940年11月接任台湾总督府总务长官。因正逢二战战争尖峰期，为了实行南进政策，任内积极实施皇民化。除了推行日语文，禁止汉宗教风俗习惯。1942年后，战争情势突变，扩大实施战时物资的配给与管制。

18、成田一郎：（1945.1.6 - 1945.8）：1945年1月受内务省大臣大达茂雄推荐，前往台湾担任总务长官。1945年8月，二战结束，台湾进入中华民国时期，不久，他随日籍官员一起被国民政府遣送回日本。